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Characterization of antibiotic resistance and species diversity of staphylococci isolated from apparently healthy farm animals

*Igbinosa, E. O., and Beshiru, A
Applied Microbial Processes & Environmental Health Research Group,
Department of Microbiology, Faculty of Life Sciences, University of Benin, PMB 1154, Benin City, Nigeria *Correspondence to: eigbinosa@gmail.com

Abstract:
Background: Staphylococcus species are adaptable commensals usually involved in a diverse multiplicity of ailments in animals and humans. This study surveyed the occurrence, antibiotic-resistance profile and putative resistant genetic elements of staphylococci isolates from apparently healthy farm animals Methodology: Nasal and rectal samples were collected from a total of 400 cows and pigs in Benin City between May and December 2017. Staphylococci were isolated following aerobic cultures of samples using standard microbiological methods. Susceptibility profiles of the isolates to eighteen selected antimicrobials were determined using the Kirby-Bauer disk diffusion test. Species of staphylococci were established and antibiotic resistance genes detected by the polymerase chain reaction using species-specific and antibiotic-resistant primers respectively Result: A total of 139 staphylococci isolates were phenotypically and genotypically identified from the food-producing animals; 87 (62.6%) from pigs and 52 (37.4%) from cows. The most frequent Staphylococcus species were Staphylococcus haemolyticus 38 (27.3%), Staphylococcus aureus 27 (19.4%) and Staphylococcus capitis 21 (15.1%). Antibiotic resistance profile showed 120 (86.3%) isolates to be resistant to penicillin G, 100 (71.9%) to nalidixic acid and 99 (71.2%) to minocycline. The prevalence of antibiotic resistance genes assessed were mecA 78 (56.1%), mphC 23 (16.6%), and ermA 20 (14.4%). Conclusion: Our finding indicates that food animals are potential reservoirs of antibiotic resistant staphylococci which pose a significant threat to food security and public health.

Keywords: food animals; antibiotic-resistant; foodborne pathogen; staphylococci; resistance elements

Received March 21, 2019; Revised May 22, 2019; Accepted May 27, 2019
Copyright 2019 AJCEM Open Access. This article is licensed and distributed under the terms of the Creative Commons Attrition 4.0 International License (//creativecommmons.org/licenses/by/4.0), which permits unrestricted use, distribution and reproduction in any medium, provided credit is given to the original author(s) and the source.

Caractérisation de la résistance aux antibiotiques et de la diversité des espèces de staphylocoques isolés d’animaux de ferme apparemment en bonne santé

*Igbinosa, E. O., et Beshiru, A
Groupe de recherche sur les processus microbiens appliqués et la santé environnementale, Département de microbiologie, Faculté des sciences de la vie, Université du Bénin, PMB 1154, Benin City, Nigéria. *Correspondance à: eigbinosa@gmail.com

Abstrait:
Contexte: Les espèces de Staphylococcus sont des agents commensaux adaptables généralement impliqués dans une grande diversité de maladies chez les animaux et les humains. Cette étude a examiné l’occurrence, le profil de résistance aux antibiotiques et les éléments génétiques potentiellement résistants d’isolats de staphylocoques provenant d’animaux d’élevage apparemment en bonne santé. Méthodologie: Des échantillons nasaux et rectaux ont été prélevés chez 400 vaches et porcs au total dans la ville de Benin City entre mai et décembre 2017. Les staphylocoques ont été isolé suite à des cultures aérobies d’échantillons à l’aide de méthodes microbiologiques standard. Les profils de sensibilité des isolats à dix-huit antimicrobiens sélectionnés ont été déterminés à l’aide du test de diffusion sur disque Kirby-Bauer. Les espèces
Antibiotic resistant staphylococci from healthy farm animals Afr. J. Clin. Exper. Microbiol. 2019; 20 (4): 289-298
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de staphylocoques ont été établies et les gènes de résistance aux antibiotiques ont été détectés par réaction en chaîne de la polymérase en utilisant respectivement des amorces spécifiques à l’espèce et des bactéries résistantes aux
Résultat: Un total de 139 isolats de staphylocoques ont été identifiés phénotypiquement et génotypiquement à partir des animaux producteurs d’aliments. 87 (62,6%) de porcs et 52 (37,4%) de vaches. Les espèces de Staphylococcus les plus fréquentes étaient Staphylococcus haemolyticus 38 (27,3%), Staphylococcus aureus 27 (19,4%) et Staphylococcus capitis 21 (15,1%). Le profil de résistance aux antibiotiques a montré que 120 (86,3%) des isolats étaient résistants à la pénicilline G, 100 (71,9%) à l’acide nalidixique et 99 (71,2%) à la minocycline. La prévalence des gènes de résistance aux antibiotiques évalués était mecA 78 (56,1%), mphC23 (16,6%) et ermA 20 (14,4%). Conclusion: nos résultats indiquent que les animaux destinés à l’alimentation sont des réservoirs potentiels de staphylocoques résistants aux antibiotiques qui constituent une menace importante pour la sécurité alimentaire et la santé publique

Mots-clés: animaux d’élevage; résistant aux antibiotiques; agent pathogène d’origine alimentaire; staphylocoques, éléments de résistance

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Characterization of antibiotic resistance and species diversity of staphylococci isolated from apparently healthy farm animals

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Biochemical and bacteriological profiles of asymptomatic bacteriuria among school children in Ago-Iwoye, Nigeria

Popoola, O. D., Agu, G. C., Oyeyipo, F. M., and *Thomas, B. T.
Department of Microbiology, Olabisi Onabanjo University, Ago Iwoye, Ogun State, Nigeria
*Correspondence to: benthoa2013@gmail.com; ORCID: //orcid.org/0000-0003-0675-5749

Abstract:
Background: Asymptomatic bacteriuria (ASB) in children is a predisposing factor to symptomatic urinary tract
infection (UTI) that may be complicated by blood stream infections if not appropriately treated with resultant
mortality or morbidity. The objectives of this study are to determine the prevalence of ASB, and evaluate both
biochemical and bacteriological characteristics of urine samples of primary school pupils in Ago-Iwoye, Ijebu North
Local Government Area (LGA), Ogun State, Nigeria.
Methodology: Three hundred and seventy-two (186 males and 186 females) apparently healthy (asymptomatic)
pupils aged 2-16 years from four randomly selected primary schools in the LGA were screened for ASB. Clean catch
specimen of midstream urine was collected from each subject. Biochemical analysis of the urine was performed
with Combi 10 reagent strip. MacConkey and Cysteine Lactose Electrolyte Deficient (CLED) agar plates were
inoculated with calibrated wireloop delivering 0.01 ml of urine for aerobic culture at 37oC for 24 hours.
Identification of significant bacteria on culture plates was done using conventional biochemical tests.
Results: The frequency of clear, slightly turbid and turbid urine were 31 (8.3%), 99 (26.6%) and 56 (15.1%)
respectively. All analyzed urine samples were alkaline and negative for ketone, glucose and blood, but contained
protein in 230 (61.8%), bilirubin in 184 (49.5%), nitrites in 64 (17.2%) and urobilinogen in 14 (3.7%) subjects.
The prevalence of significant bacteriuria was 11.8% (44 of 372) with 7.0% in males and 16.7% in females (p =
0.0063). The frequency of bacteria isolated in descending order were Escherichia coli 61.4%, Staphylococcus
saprophyticus 61.4%, Staphylococcus aureus 45.5%, Bacillus subtilis 45.5%, Enterococcus faecalis 43.2%,
Enterobacter spp 36.4%, Serratia marscencen 31.8%, Klebsiella pneumoniae 22.7%, Proteus mirabilis 22.7% and
Pseudomonas aeruginosa 20.5%.
Conclusion: This result highlights the presence of significant bacteriuria among apparently healthy pupils in the
study area, with higher prevalence in the female pupils. The apparent risk of developing symptomatic UTI with the
attendant complications in these pupils should spur preventive education of parents/guardians and the general
populace about this entity.

Keywords: Asymptomatic bacteriuria, S. saprophyticus, morbidity, prevalence, primary school pupils

Received April 11, 2019; Revised June 09, 2019; Accepted June 12, 2019
Copyright 2019 AJCEM Open Access. This article is licensed and distributed under the terms of the Creative Commons Attrition 4.0
International License (//creativecommmons.org/licenses/by/4.0), which permits unrestricted use, distribution and reproduction
in any medium, provided credit is given to the original author(s) and the source.

Profils biochimiques et bactériologiques de la bactériurie
asymptomatique chez des écoliers à Ago-Iwoye, Nigéria

Popoola, O. D., Agu, G. C., Oyeyipo, F. M., et *Thomas, B. T.
Département de microbiologie, Université Olabisi Onabanjo, Ago-Iwoye, État d’Ogun, Nigéria
*Correspondance à: benthoa2013@gmail.com; ORCID: //orcid.org/0000-0003-0675-5749

Abstrait:
Contexte: La bactériurie asymptomatique chez l’enfant est un facteur prédisposant à l’infection symptomatique
des voies urinaires qui peut se compliquer d’infections du flux sanguin s’il n’est pas traité correctement avec la
Asymptomatic bacteriuria in school children Afr. J. Clin. Exper. Microbiol. 2019; 20 (4): 299-305
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mortalité ou la morbidité qui en résulte. Les objectifs de cette étude sont de déterminer la prévalence d’ASB et
d’évaluer les caractéristiques biochimiques et bactériologiques d’échantillons d’urine d’élèves du primaire à Ago-
Iwoye, région du gouvernement local d’Ijebu North, État d’Ogun, au Nigéria.
Méthodologie: Trois cent soixante douze (186 garçons et 186 filles) des élèves apparemment sains
(asymptomatiques) âgés de 2 à 16 ans de quatre écoles primaires sélectionnées au hasard dans la LGA ont été
soumis à un dépistage du PNA. Des échantillons de capture d’urine à mi-parcours ont été recueillis chez chaque
sujet. L’analyse biochimique de l’urine a été réalisée avec une bandelette de réactif Combi 10. Des plaques de
gélose MacConkey et Cysteine Lactose Déficient en électrolyte (CLED) ont été inoculées avec du fil électrolytique
calibré, délivrant 0,01 ml d’urine pour une culture aérobie à 37 ° C pendant 24 heures. L’identification des
bactéries significatives sur des plaques de culture a été réalisée à l’aide de tests biochimiques classiques
Résultats: La fréquence des urines claires, légèrement troubles et troubles était respectivement de 31 (8,3%), 99
(26,6%) et 56 (15,1%). Tous les échantillons d’urine analysés étaient alcalins et négatifs pour la cétone, le glucose
et le sang, mais contenaient des protéines chez 230 (61,8%), de la bilirubine chez 184 (49,5%), des nitrites chez
64 (17,2%) et de l’urobilinogène chez 14 (3,7%). La prévalence de la bactériurie significative était de 11,8% (44
sur 372) avec 7,0% chez les hommes et 16,7% chez les femmes (p = 0,0063). La fréquence des bactéries isolées
par ordre décroissant était Escherichia coli 61,4%, Staphylococcus saprophyticus 61,4%, Staphylococcus aureus
45,5%, Bacillus subtilis 45,5%, Enterococcus faecalis 43,2%, Enterobacter spp 36,4%, Serratia marcescens
31,8%, Klebsiella pneumoniae, Proteus mirabilis 22,7% et Pseudomonas aeruginosa 20,5%.
Conclusion: Ce résultat met en évidence la présence d’une bactériurie significative chez les élèves apparemment
en bonne santé dans la zone d’étude, avec une prévalence plus élevée chez les élèves de sexe féminin. Le risque
apparent de développer une infection urinaire symptomatique accompagnée des complications associées chez ces
élèves devrait inciter à l’éducation préventive des parents / tuteurs et de la population en général sur cette entité.

Mots-clés: bactériurie asymptomatique, S. saprophyticus, morbidité, prévalence, élèves du primaire

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Biochemical and bacteriological profiles of asymptomatic bacteriuria among school children in Ago-Iwoye, Nigeria

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Bacteria urinary tract infection in HIV-infected children and adolescents in Abuja, Nigeria: a cross-sectional study

  1. 1Okechukwu, A. A., and 2Thairu, Y. Departments of 1Paediatrics and 2Microbiology, University of Abuja Teaching Hospital, Gwagwalada, Abuja, Nigeria
    Correspondence to: nebokest@yahoo.com; +2348036719906

Abstract:

Background: Urinary tract infection (UTI) remains the second commonest opportunistic infections among HIV infected children. This study was conducted to determine the prevalence and causative bacteria of UTI in HIV infected children and adolescents on antiretroviral medications in our health institution. Method: The study was a cross sectional design conducted between October 2017 and March 2018 among HIV infected children and adolescents aged 2 months to 18 years on follow up attendance at the Paediatric Outpatient Special Treatment Clinic (POSTC) of University of Abuja Teaching Hospital (UATH). Early morning midstream urine was collected from each participant for urinalysis, microscopy and aerobic bacterial culture. Bacteria were identified from culture by standard microbiological methods and antibiogram of the isolates was determined by the disk diffusion method. Result: Of 166 HIV infected children and adolescents studied, 106 (63.9%) were males, 82 (49.4%) were in age group 5-10 years, and 110 (66.3%) were from lower socio-economic class. Significant bacteria (UTI) were isolated in 54 (32.5%) subjects, with 38 (70.4%) from females, and 51 (94.4%) from those on first line antiretroviral therapy. Isolates recovered were Escherichia coli 20 (37.0%), Klebsiella pneumoniae 16 (29.6%), Staphylococcus aureus 8 (14.8%), Pseudomonas aeruginosa 6 (11.1%), and Proteus mirabilis 4 (7.4%). Leucocyturia in 19 (35.2%), nitrituria in 10 (18.5%), and haematuria in 15 (27.8%) subjects with significant bacteriuria were also recorded. Isolates were sensitive to ofloxacin (81.5%), nalidixic acid (74.1%) and cefuroxime (61.1%), while they were resistant to cotrimoxazole (100%), ampicillin (98.1%) and piperacillin (94.4%). Significant difference was observed in the mean CD4 cell count and viral load of subjects with significant bacteriuria compared to those without; 838.6 ± 177.8 versus 1009.9 ± 234.7 cells/μL (p=0.02), and 10, 360.5 ± 471.0 versus 5, 840.8 ± 563.8 copies/ml (p=0.003) for CD4 cell count and viral load respectively. Conclusion: This study reported a high prevalence of UTI among HIV infected children and adolescents, especially in those with high viral load. Routine screening for UTI should be offered to HIV infected children and adolescents with high viral load.

Keywords: HIV, urinary tract infection, children, adolescents

Received March 4, 2019; Revised June 22, 2019; Accepted July 13, 2019
Copyright 2019 AJCEM Open Access. This article is licensed and distributed under the terms of the Creative Commons Attrition 4.0 International License (//creativecommmons.org/licenses/by/4.0), which permits unrestricted use, distribution and reproduction in any medium, provided credit is given to the original author(s) and the source.

Infection des voies urinaires par des bactéries chez des enfants et des adolescents infectés par le VIH à Abuja, au Nigeria: étude transversale

1Okechukwu, A. A., et 2Thairu, Y.
Départements de 1pédiatrie et 2microbiologie, Hôpital universitaire de Abuja, Gwagwalada, Abuja, Nigeria Correspondance à: nebokest@yahoo.com; +2348036719906
Bacteria UTI in HIV infected children and adolescents Afr. J. Clin. Exper. Microbiol. 2019; 20 (4): 306-314
307
Abstrait:

Contexte: L’infection des voies urinaires (UTI) reste la deuxième infection opportuniste la plus répandue chez les enfants infectés par le VIH. Cette étude a été menée pour déterminer la prévalence et la bactérie causale des infections urinaires chez les enfants et les adolescents infectés par le VIH prenant des antirétroviraux dans notre établissement de santé. Méthode: L’étude était une conception transversale menée entre octobre 2017 et mars 2018 chez des enfants et des adolescents infectés par le VIH âgés de 2 mois à 18 ans et suivis à la Clinique de traitement spécial pour enfants ambulatoires (POSTC) de l’Hôpital universitaire de Abuja (UATH) ). Des échantillons d’urine, de microscopie et de cultures bactériennes aérobies ont été recueillis chez chaque participant. Les bactéries ont été identifiées à partir de cultures par des méthodes microbiologiques standard et l’antibiogramme des isolats a été déterminé par la méthode de diffusion sur disque. Résultat: Sur 166 enfants et adolescents infectés par le VIH étudiés, 106 (63,9%) étaient des hommes, 82 (49,4%) étaient âgés de 5 à 10 ans et 110 (66,3%) appartenaient à la classe socio-économique inférieure. Des bactéries significatives (UTI) ont été isolées chez 54 sujets (32,5%), dont 38 (70,4%) de femmes et 51 (94,4%) de celles sous traitement antirétroviral de première intention. Les isolats récupérés étaient Escherichia coli 20 (37,0%), Klebsiella pneumoniae 16 (29,6%), Staphylococcus aureus 8 (14,8%), Pseudomonas aeruginosa 6 (11,1%) et Proteus mirabilis 4 (7,4%). Une leucocyturie chez 19 sujets (35,2%), une nitriturie chez 10 (18,5%) et une hématurie chez 15 sujets (27,8%) présentant une bactériurie importante ont également été enregistrés. Les isolats étaient sensibles à l’ofloxacine (81,5%), à l’acide nalidixique (74,1%) et au céfuroxime (61,1%), tandis qu’ils étaient résistants au cotrimoxazole (100%), à l’ampicilline (98,1%) et à la pipéracilline (94,4%). Une différence significative a été observée entre le nombre moyen de cellules CD4 et la charge virale des sujets présentant une bactériurie significative par rapport à ceux ne présentant pas; 838,6 ± 177,8 par rapport à 1009,9 ± 234,7 cellules/μL (p = 0,02) et 10, 360,5 ± 471,0 par rapport à 5 840,8 ± 563,8 copies/ml (p = 0,003) pour le nombre de cellules CD4 et la charge virale, respectivement. Conclusion: Cette étude a révélé une prévalence élevée d’UTI chez les enfants et les adolescents infectés par le VIH, en particulier chez ceux ayant une charge virale élevée. Un dépistage systématique des infections urinaires doit être proposé aux enfants et aux adolescents à charge virale élevée infectés par le VIH

Mots-clés: VIH, infection des voies urinaires, enfants, adolescents

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Bacteria urinary tract infection in HIV-infected children and adolescents in Abuja, Nigeria a cross-sectional study

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Effect of physical stresses on survivability and post-exposure antibiotic susceptibility of coliforms in environmental waters and wastewaters

*Adebisi, O. O., Gbala, I. D., Akinsolu, F. T., and Olayemi, A. B.
Section of Integrative Bioenergetics Environmental and Ecotoxicological Systems, Department of Microbiology, Faculty of Life Sciences, University of Ilorin, P.M.B. 1515, Ilorin, Nigeria *Correspondence to: oo.adebisi@outlook.com; soji-olusegun@unilorin.edu.ng

Abstract:
Background: Coliform bacteria are majorly introduced into water bodies (river and wastewater) as a result of faecal pollution, agricultural run-offs and several anthropogenic activities. Despite the effectiveness of water treatment methods, pathogens still persist in water; hence the relevance of assessing the ability of these pathogens to survive the lethal actions of physical stresses and the possible impact on antibiotic susceptibility pattern of the organisms. Methodology: The survivability of Escherichia coli strains (NCM3722, FAP1 and ST2747), Enterobacter cloacae GGT036 and Shigella sonnei 53G was assessed in environmental and waste waters for 21 days. The effect of three treatment regimens (UV radiation, solar radiation and boiling) on the survival of the coliforms was evaluated. Also, the antibiogram of the isolates post–UV exposure was assayed. Results: Although there was significant reduction (≥ 3-log) in the population of the bacteria overtime, all the coliforms survived in the waters for 21 days. The effect of UV radiation was significant on all organisms (> 3 log reductions). Solar radiation for 60 minutes had significantly lesser effect than boiling for 15 minutes. Surviving cells of all isolates demonstrated multiple drug-resistance post exposure to UV radiation. Conclusion: This study revealed the ability of coliforms to persist in waters after treatment and proves that UV radiation may not be effective in attenuation of antibiotic resistance.

Keywords: Survivability; Coliforms; Antibiotic susceptibility; Water; Wastewater

Received December 17, 2018; Revised June 2, 2019; Accepted June 3, 2019
Copyright 2019 AJCEM Open Access. This article is licensed and distributed under the terms of the Creative Commons Attrition 4.0 International License (//creativecommmons.org/licenses/by/4.0), which permits unrestricted use, distribution and reproduction in any medium, provided credit is given to the original author(s) and the source.

Effet des contraintes physiques sur la capacité de survie et la susceptibilité aux antibiotiques post-exposition aux coliformes dans les eaux de surface et les eaux usées

*Adebisi, O. O., Gbala, I. D., Akinsolu, F. T., et Olayemi, A. B.
Section de la bioénergétique intégrative Systèmes environnementaux et écotoxicologiques, Département de microbiologie, Faculté des sciences de la vie, Université d’Ilorin, P.M.B. 1515, Ilorin, Nigeria
*Correspondance à: oo.adebisi@outlook.com; soji-olusegun@unilorin.edu.ng

Abstrait:
Contexte: Les bactéries coliformes sont principalement introduites dans les eaux (rivières et eaux usées) en raison de la pollution fécale, des écoulements agricoles et de plusieurs activités anthropiques. Malgré l’efficacité des méthodes de traitement de l’eau, les agents pathogènes persistent dans l’eau; D’où la pertinence d’évaluer la capacité de ces agents pathogènes à survivre aux actions létales des stress physiques et à l’impact possible sur le profil de sensibilité des organismes aux antibiotiques. Méthodologie: La capacité de survie des souches d’Escherichia coli (NCM3722, FAP1 et ST2747), de Enterobacter cloacae GGT036 et de Shigella sonnei 53G a été évaluée pendant 21 jours dans des eaux environnementales et des eaux usées. L’effet de trois schémas thérapeutiques (rayonnement UV, rayonnement solaire et ébullition) sur la survie des coliformes a été évalué. En outre, l’antibiogramme des isolats après l’exposition aux UV a été testé.
Résultats: Bien qu’il y ait eu une réduction significative (≥ 3 log) de la population de bactéries en heures supplémentaires, tous les coliformes ont survécu dans les eaux pendant 21 jours. L’effet du rayonnement UV était significatif sur tous les organismes (réductions de> 3 log). Le rayonnement solaire pendant 60 minutes a eu un effet significativement moindre que celui d’ébullition pendant 15 minutes. Les cellules survivantes de tous les isolats ont démontré une résistance multiple aux médicaments après une exposition aux rayons UV.
Conclusion: cette étude a révélé la capacité des coliformes à persister dans les eaux après traitement et prouve que le rayonnement UV peut ne pas atténuer efficacement la résistance aux antibiotiques.

Mots-clés: Survivabilité; Les coliformes; Sensibilité aux antibiotiques; Eau; Eaux usées

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Effect of physical stresses on survivability and post-exposure antibiotic susceptibility of coliforms in environmental waters and wastewaters

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Phenotypic characterization of mycobacteria isolates from tuberculosis patients in Kaduna State, Nigeria

1,2Ahmadu, I., 1Olonitola, O. S., 1Suleiman, A. B., 3Lawan, M. K., and 4Makolo, D. 1Department of Microbiology, Faculty of Life Sciences, Ahmadu Bello University, Zaria, Nigeria 2National Tuberculosis Reference Laboratory, Zaria, Nigeria 3Department of Veterinary Public Health and Preventive Medicine, Faculty of Veterinary Medicine, Ahmadu Bello University, Zaria, Nigeria 4Department of Sciences, School of Preliminary Studies, Kogi State Polytechnic, Lokoja, Nigeria

Correspondence to: isiyakuadabka@yahoo.com Abstract: Background: Tuberculosis (TB) remains one of the leading public health challenges in Nigeria and the burden is still high. There is hence a need for continuous characterization of mycobacteria to obtain current data that will aid the ongoing TB prevention and control programme. The aim of this study was to phenotypically characterize mycobacteria isolates recovered from clinical specimens of patients with tuberculosis in Kaduna State, Nigeria.

Methods: Two thousand, two hundred and twelve (2212) sputum samples were collected from patients clinically suspected to have TB in three different zones of Kaduna State, Nigeria, between May 2017 and October, 2018. Samples were processed by decontaminating with NaOH-Citrate N-acetyl-L-Cystein method for Ziehl Neelsen (ZN) AFB microscopy and culture on Lowenstein Jensen (LJ) slants which were incubated at 37ᵒC for 8 weeks. Positive LJ cultures were further analyzed with a rapid TB antigen assay (SD-Bioline) to differentiate Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC) from Non Tuberculous Mycobacteria (NTM). Results: Out of the 2212 patients with suspected TB, 300 (13.6%) were positive for AFB by microscopy with Zone A (Kaduna North) having the highest AFB positive cases of 169 (15.2%). Of the 300 AFB positive samples, 272 (91.0%) were culture positive on LJ medium, 18 (6.0%) were culture negative and 10 (3.0%) were culture contaminated. Result of the distribution of mycobacteria among infected patients within the study area revealed that 219 (80.5%) were infected with MTBC, 42 (15.4%) with NTM and 11 (4.0%) with both MTBC and NTM. Conclusion: A relatively high number of TB in the study area was caused by NTM. There is need for advanced diagnostic tools that can differentiate MTBC and NTM strains among TB patients in all TB Reference Laboratories in Nigeria.

Keywords: Phenotypic, Characterization, Tuberculosis, Mycobacteria

Received May 25, 2019; Revised July 24, 2019; Accepted July 26, 2019
Copyright 2019 AJCEM Open Access. This article is licensed and distributed under the terms of the Creative Commons Attrition 4.0 International License (//creativecommmons.org/licenses/by/4.0), which permits unrestricted use, distribution and reproduction in any medium, provided credit is given to the original author(s) and the source.

Caractérisation phénotypique d’isolats de mycobactéries provenant de patients atteints de tuberculose dans l’État de Kaduna, au Nigéria

1,2Ahmadu, I., 1Olonitola, O. S., 1Suleiman, A. B., 3Lawan, M. K., et 4Makolo, D.
1Département de microbiologie, Faculté des sciences de la vie, Université Ahmadu Bello, Zaria, Nigeria 2Laboratoire national de référence sur la tuberculose, Zaria, Nigéria 3Département de santé publique vétérinaire et de médecine préventive, Faculté de médecine vétérinaire, Université Ahmadu Bello, Zaria, Nigéria 4Département des sciences, École d’études préliminaires, École polytechnique d’État de Kogi, Lokoja, Nigéria Correspondance à: isiyakuadabka@yahoo.com

Abstrait:

Contexte: La tuberculose reste l’un des principaux problèmes de santé publique au Nigéria et le fardeau est encore lourd. Il est donc nécessaire de caractériser en permanence les mycobactéries pour obtenir les données actuelles qui aideront le programme de prévention et de contrôle de la tuberculose en cours. Le but de cette étude était de caractériser phénotypiquement les isolats de mycobactéries récupérés à partir d’échantillons cliniques de patients atteints de tuberculose dans l’État de Kaduna, au Nigéria. Méthodes: Deux mille douze cent douze (2212) échantillons d’expectorations ont été prélevés chez des patients cliniquement suspects de tuberculose dans trois zones différentes de l’État de Kaduna, au Nigéria, entre mai 2017 et octobre 2018. Les échantillons ont été traités par décontamination au NaOH-citrate. Méthode N-acétyl-L-Cystéine pour la microscopie AFB de Ziehl Neelsen (ZN) et culture sur des pentes de Lowenstein Jensen (LJ) qui ont été incubées à 37 ° C pendant 8 semaines. Les cultures de LJ positives ont ensuite été analysées avec un dosage rapide de l’antigène de la tuberculose (SD-Bioline) afin de différencier le complexe Mycobacterium tuberculosis (MTBC) des mycobactéries non tuberculeuses (NTM). Résultats: Sur les 2212 patients suspects de tuberculose, 300 (13,6%) étaient positifs pour AFB par microscopie, la zone A (Kaduna North) présentant le plus grand nombre de cas positifs avec 169 (15,2%). Sur les 300 échantillons AFB positifs, 272 (91,0%) étaient positifs en culture sur le milieu LJ, 18 (6,0%) étaient négatifs en culture et 10 (3,0%) étaient contaminés par la culture. Le résultat de la distribution des mycobactéries parmi les patients infectés dans la zone d’étude a révélé que 219 (80,5%) étaient infectés par le MTBC, 42 (15,4%) avec les NTM et 11 (4,0%) avec les deux types de MTBC. Conclusion: Un nombre relativement élevé de tuberculose dans la zone d’étude a été causée par les MNT. Il existe un besoin d’outils de diagnostic avancés permettant de différencier les souches de MTBC et de MNT parmi les patients atteints de tuberculose dans tous les laboratoires de référence pour la tuberculose au Nigeria.

Mots-clés: Phénotypique, Caractérisation, Tuberculose, Mycobactéries

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Phenotypic characterization of mycobacteria isolates from tuberculosis patients in Kaduna State, Nigeria

 

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Prevalence and antibiotic resistance profiles of extended spectrum β-lactamase-producing Escherichia coli among paediatric patients with urinary tract infection in St. Patricks’ Hospital, Mile Four, Abakaliki, Ebonyi State, Nigeria

Iroha, I. R., Onyia, U., *Moses, I. B., Ejikeugwu, C. P., Nwakaeze, A. E., and Ugbo, E. N.
Department of Applied Microbiology, Faculty of Sciences, Ebonyi State University, Abakaliki, Nigeria *Correspondence to: ben_iyke70@yahoo.com

Abstract:
Background: The extended spectrum beta-lactamase (ESBL)-producing Escherichia coli strains which have been implicated in septicaemia among hospitalized children is a serious concern due to their high resistance rates to commonly used antimicrobial agents. The objective of this study was to determine the prevalence and antibiotic susceptibility of urinary ESBL-producing E. coli in paediatric patients who had clinical evidence of urinary tract infections (UTI). Methodology: Clean catch specimens of urine collected from 100 eligible paediatric patients with clinical evidence of UTI in St. Patricks’ Hospital, Mile Four, Abakaliki, Ebonyi State, were cultured for isolation of E. coli using standard bacteriological techniques. Isolates were confirmed for ESBL production by double disk synergy test (DDST), and antibiotic susceptibility of the ESBL-producing ones was determined by the modified Kirby Bauer disk diffusion method. Results: Twenty one (21%) E. coli were isolated out of which 11 (52 %) were ESBL producers, all of which were totally resistant (100%) to cefotaxime, ticarcillin and sulfamethoxazole-trimethoprim, 85% to aztreonam and 83% to ceftazidime. The multiple antibiotic resistance index (MARI) values ranged from 0.4 to 0.9, which implies high usage of antimicrobials Conclusion: The high prevalence of multi-drug resistant ESBL-producing E. coli obtained in this study shows that there has been overuse (abuse or misuse) of antibiotics in the study area. There is need for antimicrobial stewardship programme that will ensure prudent use of antimicrobial agents to forestall the emergence and spread of multi-drug resistant bacteria.

Keywords: Paediatrics, Escherichia coli, ESBL, urine, multi-drug resistance

Received February 8, 2019; Revised May 23, 2019; Accepted May 24, 2019
Copyright 2019 AJCEM Open Access. This article is licensed and distributed under the terms of the Creative Commons Attrition 4.0 International License (//creativecommmons.org/licenses/by/4.0), which permits unrestricted use, distribution and reproduction in any medium, provided credit is given to the original author(s) and the source.

Profils de prévalence et de résistance aux antibiotiques d’Escherichia coli produisant des β-lactamases à spectre étendu chez des patients pédiatriques présentant une infection des voies urinaires à l’hôpital St. Patricks, Mile Four, Abakaliki, État d’Ebonyi, Nigéria

Iroha, I. R., Onyia, U. * Moses, I. B., Ejikeugwu, C. P., Nwakaeze, A. E., et Ugbo, E. N.
Département de microbiologie appliquée, Faculté des sciences, Université d’Ebonyi, Abakaliki, Nigéria *Correspondance à: ben_iyke70@yahoo.com

Abstrait:
Contexte: Les souches d’Escherichia coli productrices de bêta-lactamase à spectre étendu (BLSE) qui ont été impliquées dans la septicémie chez les enfants hospitalisés constituent un grave problème en raison de leur taux de résistance élevé aux agents antimicrobiens couramment utilisés. L’objectif de cette étude était de déterminer la prévalence et la sensibilité aux antibiotiques d’E. coli producteurs de BLSE dans l’urine chez les patients pédiatriques présentant des signes cliniques d’infections des voies urinaires (UTI). Méthodologie: Des échantillons d’urine prélevés chez 100 patients pédiatriques éligibles présentant des signes cliniques d’UTI à l’hôpital St. Patricks, à Mile Four, à Abakaliki, dans l’État d’Ebonyi, ont été cultivés pour l’isolement de E. coli à l’aide de techniques bactériologiques classiques. Les isolats ont été confirmés pour la production de BLSE par un test de synergie à double disque (DDST) et la sensibilité aux antibiotiques des producteurs de BLSE a été déterminée par la méthode de diffusion sur disque de Kirby Bauer modifiée. Résultats: Vingt et un (21%) E. coli ont été isolés, dont 11 (52%) étaient des producteurs de BLSE, qui étaient tous totalement résistants (100%) au céfotaxime, à la ticarcilline et au sulfaméthoxazole-triméthoprime, 85% à l’aztréonam et au 83 % en ceftazidime. Les valeurs de l’indice de résistance multiple aux antibiotiques (MARI) allaient de 0,4 à 0,9, ce qui implique une utilisation élevée d’antimicrobiens Conclusion: La prévalence élevée d’E. coli productrice de BLSE résistante à plusieurs médicaments obtenue dans cette étude montre qu’il y a eu surutilisation (abus ou abus). ) d’antibiotiques dans la zone d’étude. Un programme de gestion des antimicrobiens est nécessaire pour garantir une utilisation prudente des agents antimicrobiens afin de prévenir l’émergence et la propagation de bactéries multirésistantes aux médicaments

Mots-clés: pédiatrie, Escherichia coli, BLSE, urine, multirésistance

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Prevalence and antibiotic resistance profiles of extended spectrum β-lactamase-producing Escherichia coli among paediatric patients with urinary tract infection in St. Patricks’ Hospital, Mile Four, Abakaliki, Ebonyi State, Nigeria

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Prevalence of HIV infection among newly admitted students in Ebonyi State University, Abakaliki, Nigeria

*Nworie, A., Kalu, M. E., Usanga, V. U., and Ibe, O. E.
Department of Medical Laboratory Science, Ebonyi State University, Abakaliki, Nigeria
*Correspondence to: nworieamos@gmail.com; Mobile: +2348100226465

Abstract:
Background: Human immunodeficiency virus (HIV) and the associated acquired immune deficiency syndrome (AIDS) have remained a serious scourge and a major public health concern, affecting millions in sub-Saharan Africa despite awareness campaigns, preventive measures and promotion of antiretroviral regimens. This study determined the prevalence of HIV among newly admitted students of Ebonyi State University as a measure of the impact of awareness campaign towards prevention of HIV transmission.
Methods: Newly admitted students of Ebonyi State University totalling 2,736 who voluntarily enrolled for the study were screened for HIV infection using the national HIV testing algorithm after information relating to their personal lifestyle, knowledge of safer sex and preventive measures have been obtained with the use of a client intake form.
Results: Of the 2,736 subjects screened, 6 were positive for HIV, giving a prevalence rate of 0.22%, with prevalence rate of 0.29% (4 of 1344) in females and 0.14% (2 of 1392) in males (X2=0.2041, p=0.6514). The positive subjects were spread across age groups 15-19 years (1), 20-24 years (4) and 25-29 years (1). Males and females who have had sex were 801 and 579 out of which 239 and 209 respectively acknowledged to have had unprotected sex within three months of the study.
Conclusion: The low HIV prevalence rate of 0.22% among school age and young adults in this study may indicate that awareness and safe sex campaigns in Ebonyi State have positive impact in HIV prevention amongst these groups of people.

Keywords: HIV, students, Ebonyi State University, Nigeria, prevalence, campaign

Received May 19, 2019; Revised July 15, 2019; Accepted July 16, 2019
Copyright 2019 AJCEM Open Access. This article is licensed and distributed under the terms of the Creative Commons Attrition 4.0 International License (//creativecommmons.org/licenses/by/4.0), which permits unrestricted use, distribution and reproduction in any medium, provided credit is given to the original author(s) and the source.

Prévalence de l’infection à VIH chez les étudiants nouvellement admis à l’Université d’Ebonyi, Abakaliki, Nigéria

*Nworie, A., Kalu, M. E., Usanga, V. U., et Ibe, O. E.
Département des sciences de laboratoire médical, université d’État Ebonyi, Abakaliki, Nigéria
*Correspondance à: nworieamos@gmail.com; Mobile: +2348100226465

Abstrait:
Contexte: le virus de l’immunodéficience humaine (VIH) et le syndrome d’immunodéficience acquise (SIDA) associé restent un grave fléau et un grave problème de santé publique, touchant des millions de personnes en Afrique subsaharienne en dépit des campagnes de sensibilisation, des mesures préventives et de la promotion des schémas thérapeutiques antirétroviraux. Cette étude a déterminé la prévalence du VIH parmi les étudiants nouvellement admis à l’Université d’Ebonyi en tant que mesure de l’impact de la campagne de sensibilisation sur la prévention de la transmission du VIH.
Méthodes: Les étudiants nouvellement admis à l’Université d’Ebonyi, sur un total de 2 736 inscrits volontairement à l’étude, ont été dépistés pour l’infection à VIH à l’aide de l’algorithme national de dépistage du VIH, après que des informations relatives à leur mode de vie personnel, à leur connaissance du sexe sans risque et à des un formulaire d’admission du client.
Résultats: Sur les 2 736 sujets dépistés, 6 étaient séropositifs, soit un taux de prévalence de 0,22%, avec un taux de prévalence de 0,29% (4 sur 1344) chez les femmes et de 0,14% (2 sur 1392) chez les hommes (X2 = 0,2041, p = 0,6514). Les sujets positifs étaient répartis dans les groupes d’âge 15-19 ans (1), 20-24 ans (4) et 25-29 ans (1). Les hommes et les femmes ayant eu des rapports sexuels comptaient 801 et 579 personnes, dont 239 et 209 respectivement ont reconnu avoir eu des rapports sexuels non protégés dans les trois mois suivant l’étude.
Conclusion: Le faible taux de prévalence du VIH de 0,22% chez les enfants d’âge scolaire et les jeunes adultes dans cette étude peut indiquer que les campagnes de sensibilisation et de promotion du sexe sans risque dans l’État d’Ebonyi ont un impact positif sur la prévention du VIH parmi ces groupes de personnes

Mots-clés: VIH, étudiants, université d’Ebonyi, Nigéria, prévalence, campagne

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Prevalence of HIV infection among newly admitted students in Ebonyi State University, Abakaliki, Nigeria

 

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Bacteriological profiles of acute suppurative otitis media in children in Brazzaville, Congo

1Otouana Dzon, H. B., 1Ngouoni, G. C., 2Diembi, S., 1Tsierie-Tsoba, A., 3Kambourou, J., 1Itiere-Odzili, F. A., and 1Ondzotto, G. 1Otolaryngology Department, Brazzaville University Hospital Center, BP 13356, Congo
2Otolaryngology Department, General Hospital, Adolph Sicé, Congo 3Paediatric Intensive Care Department, Brazzaville University Hospital Center, Congo
Correspondence to: hb.otouana@gmail.com; (00242) 069422411

Abstract:

Background: Acute suppurative otitis media (ASOM) is one of the main indications for antibiotic prescription in children. The close proximity of the middle ear to the brain and the increasing resistance of microbial organisms involved in otitis media make this pathology of great concern in children. The objective of this study is to determine the bacteriological profile of acute otitis media in Congo as a guide to the choice of antibiotics for empirical therapy. Methodology: A cross sectional study of children less than 17 years old with acute suppurative otitis media in the otorhinolaryngology service of the Brazzaville University Hospital, Congo, was conducted over a 14 month period. All subjects whose samples were sterile or contaminated (poly-microbial culture) and those who received antibiotic-corticosteroid therapy were excluded. The identification of bacteria to species level was done using conventional biochemical identification tests scheme. Antibiotic sensitivity was performed on isolates using the modified Bauer Kirby disk diffusion test on plain Mueller Hinton (MH) agar and MH agar with 5% horse blood. Results: Four bacteria families/species were identified; Staphylococcus aureus (32.7%), family Enterobacteriaceae (28.6%), Streptococcus pneumoniae (26.5%) and Pseudomonas aeruginosa (12.2%). Ps. aeruginosa was associated with greenish otorrhea while S. aureus, Enterobacteriaceae and S. pneumoniae were associated with yellowish otorrhea (p = 0.001). Conclusion: The bacterial aetiology of acute suppurative otitis media varies from country to country. In Congo, this study reports four main bacteria families/species involved in acute otitis media with high resistance to β-lactam antibiotics but high sensitivity to macrolides and fluoroquinolones.

Key words: otitis; child; antibiogram; bacteria; Brazzaville

Received March 25, 2019; Revised June 11, 2019; Accepted June 12, 2019
Copyright 2019 AJCEM Open Access. This article is licensed and distributed under the terms of the Creative Commons Attrition 4.0 International License (//creativecommmons.org/licenses/by/4.0), which permits unrestricted use, distribution and reproduction in any medium, provided credit is given to the original author(s) and the source.

Profils bactériologiques de l’otite moyenne suppurative aiguë chez les enfants à Brazzaville, Congo

1Otouana Dzon, H. B., 1Ngouoni, G. C., 2Diembi, S., 1Since-Tsoba, A., 3Kambourou, J.,
1Itiere-Odzili, F. A., et 1Ondzotto, G.
1 Département d’oto-rhino-laryngologie, Centre hospitalier universitaire de Brazzaville, BP 13356, Congo
2 Département d’oto-rhino-laryngologie, Hôpital général, Adolph Sicé, Congo
3 Service de soins intensifs pédiatriques, Centre hospitalier universitaire de Brazzaville, Congo
Correspondance à: hb.otouana@gmail.com; (00242) 069422411

Abstrait:
Contexte: L’otite moyenne suppurative aiguë est l’une des principales indications de la prescription d’antibiotiques chez les enfants. La proximité de l’oreille moyenne au cerveau et la résistance croissante des organismes microbiens impliqués dans l’otite moyenne rendent cette pathologie extrêmement préoccupante chez les enfants. L’objectif de cette étude est de déterminer le profil bactériologique de l’otite moyenne aiguë au Congo en tant que guide pour le choix des antibiotiques pour un traitement empirique.
Méthodologie: Une étude transversale sur les enfants de moins de 17 ans atteints d’otite moyenne suppurée aiguë dans le service d’otorhinolaryngologie de l’hôpital universitaire de Brazzaville au Congo a été menée sur une période de 14 mois. Tous les sujets dont les échantillons étaient stériles ou contaminés (culture poly-microbienne) et ceux ayant reçu un traitement antibiotique-corticostéroïde ont été exclus. L’identification des bactéries au niveau de l’espèce a été réalisée à l’aide d’un programme d’essais d’identification biochimique conventionnel. La sensibilité aux antibiotiques a été réalisée sur des isolats en utilisant les tests de diffusion sur disque Bauer Kirby modifiés sur gélose Mueller Hinton (MH) et gélose MH avec 5% de sang de cheval. Résultats: Quatre familles/espèces de bactéries ont été identifiées. Staphylococcus aureus (32,7%), la famille des Enterobacteriaceae (28,6%), Streptococcus pneumoniae (26,5%) et Pseudomonas aeruginosa (12,2%). Ps. aeruginosa était associé à une otorrhée verdâtre, alors que S. aureus, Enterobacteriaceae et S. pneumoniae étaient associés à une otorrhée jaunâtre (p = 0,001). Conclusion: L’étiologie bactérienne de l’otite moyenne suppurée aiguë varie d’un pays à l’autre. Au Congo, cette étude fait état de quatre familles / espèces de bactéries principales impliquées dans les otites moyennes aiguës présentant une résistance élevée aux antibiotiques β-lactames mais une sensibilité élevée aux macrolides et aux fluoroquinolones.

Mots-clés: otite; enfant; antibiogramme; les bactéries; Congo Brazzaville

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Bacteriological profiles of acute suppurative otitis media in children in Brazzaville, Congo

 

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Molecular characterization of Methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolates from a hospital in Ghana

2 Asante, J., 1 Govinden, U., 2 Owusu-Ofori, A., 3 Bester, L.A., and 1 Essack, S. Y.

1 Antimicrobial Research Unit, College of Health Sciences, University of KwaZulu Natal, Private Bag X54001, Durban, 4000, South Africa

2 Department of Clinical Microbiology, School of Medical Sciences, Kwame Nkrumah University of Science and Technology, Kumasi, Ghana

3 Biomedical Resource Unit, School of Laboratory Medicine and Medical Sciences, University of KwaZulu Natal, Durban, South Africa

*Correspondence to: josante33@yahoo.com

Abstract

Background: Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) are a major cause of hospital- and community-acquired infection. They can colonize humans and cause a wide range of infections including pneumonia, endocarditis and bacteraemia. We investigated the molecular mechanism of resistance and virulence of MRSA isolates from a teaching hospital in Ghana. Methodology: A total of 91 S. aureus isolates constituted the initial bacterial sample. Identification of S. aureus was confirmed by the VITEK 2 system. The cefoxitin screen test was used to detect MRSA and antibiotic susceptibility was determined using the VITEK 2 system. The resistance (mecA, blaZ, aac-aph, ermC, and tetK) and virulence (lukS/F-PV, hla, hld and eta) genes were amplified by polymerase chain reaction (PCR) and positive samples subjected to DNA sequencing. Pulsed field gel electrophoresis (PFGE) was used to ascertain the relatedness of the isolates.
Results: Fifty-eight of 91 (63.7%) isolates were putatively methicillin resistant by the phenotypic cefoxitin screen test and oxacillin MICs. However, 43 (47%) of the isolates were genotypically confirmed as MRSA based on PCR detection of the mecA gene. Furthermore, 37.9% of isolates displayed resistance to tetracycline, 19% to trimethoprim-sulphamethoxazole, 15.5% to clindamycin, 12.1% to gentamicin, 13.8% to ciprofloxacin and erythromycin, 6.9% to moxifloxacin and 7.0% to rifampicin. None of the isolates was positive for inducible clindamycin resistance. The prevalence of resistance (mecA, blaZ, aac(6’)-aph(2’’), tetK, and ermC) and virulence (hla and lukS/F-PV) genes respectively were 74%, 33%, 22%, 19%, 3%, 5% and 3%, with isolates organized in two highly related clades. Conclusion: Results indicate a fairly high occurrence of MRSA, which can complicate the effective therapy of S. aureus infections, necessitating surveillance and stringent infection control programmes to forestall its spread.

Keywords: MRSA, mecA, blaZ, hla, lukS/F-PV

Revised April 9, 2019; Accepted April 11, 2019

Copyright 2019 AJCEM Open Access. This article is licensed and distributed under the terms of the Creative Commons Attrition 4.0 International License (//creativecommmons.org/licenses/by/4.0), which permits unrestricted use, distribution and reproduction in any medium, provided credit is given to the original author(s) and the source.

 

Caractérisation moléculaire d’isolats de Staphylococcus aureus résistants à la méthicilline provenant d’un hôpital du Ghana

*1, 2 Asante, J., 1 Govinden, U., 2 Owusu-Ofori, A., 3 Bester, L., and 1 Essack, S. Y.

1 Unité de recherche antimicrobienne, Collège des sciences de la santé, Université du KwaZulu Natal, Sac privé X54001, Durban, 4000, Afrique du Sud.

2 Département de microbiologie clinique, Faculté des sciences médicales, Université des sciences et technologies Kwame Nkrumah, Kumasi, Ghana

3 Unité des ressources biomédicales, École de médecine de laboratoire et des sciences médicales, Université de KwaZulu Natal, Durban, Afrique du Sud

*Correspondance à: josante33@yahoo.com

Abstrait

Contexte: Le Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline (SARM) est une cause majeure d’infection acquise à l’hôpital et dans la communauté. Ils peuvent coloniser les humains et causer un large éventail d’infections, notamment la pneumonie, l’endocardite et la bactériémie. Nous avons étudié le mécanisme moléculaire de résistance et de virulence des isolats de SARM provenant d’un hôpital universitaire au Ghana. Méthodologie: Au total, 91 isolats de S. aureus constituaient l’échantillon bactérien initial. L’identification de S. aureus a été confirmée par le système VITEK 2. Le test de dépistage à la céfoxitine a été utilisé pour détecter le SARM et la sensibilité aux antibiotiques a été déterminée à l’aide du système VITEK 2. Les gènes de résistance (mecA, blaZ, aac-aph, ermC et tetK) et de virulence (lukS/F-PV, hla, hld et eta) ont été amplifiés par une réaction en chaîne de la polymérase (PCR) et des échantillons positifs soumis à un séquençage de l’ADN. Une électrophorèse sur gel en champ pulsé (PFGE) a été utilisée pour déterminer le caractère apparent des isolats. Résultats: Cinquante-huit des 91 isolats (63,7%) étaient présumés résistants à la méthicilline par le test de dépistage phénotypique à la céfoxitine et par les CMI oxacillines. Cependant, 43 (47%) des isolats ont été confirmés génotypiquement comme SARM sur la base de la détection par PCR du gène mecA. En outre, 37,9% des isolats présentaient une résistance à la tétracycline, 19% au triméthoprime-sulfaméthoxazole, 15,5% à la clindamycine, 12,1% à la gentamicine, 13,8% à la ciprofloxacine et à l’érythromycine, 6,9% à la moxifloxacine et 7,0% à la rifampicine. Aucun des isolats n’était positif pour la résistance inductible à la clindamycine. La prévalence des gènes de résistance (mecA, blaZ, aac(6′)-aph(2”), tetK et ermC) et de virulence (hla et lukS/F-PV) était respectivement de 74%, 33%, 22%, 19%, 3%, 5% et 3%, avec des isolats organisés en deux clades fortement apparentés. Conclusion: Les résultats indiquent une présence assez élevée de SARM, ce qui peut compliquer le traitement efficace des infections à S. aureus, nécessitant une surveillance et des programmes de contrôle des infections rigoureux pour prévenir sa propagation.

Mots-clés: SARM, mecA, blaZ, hla, lukS/F-PV

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Molecular characterization of Methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolates from a hospital in Ghana

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Supplementary AJCEM 1927 Phenotypic and Genotypic Characteristics of MRSA isolates

Supplementary AJCEM 1927 DNA Sequence Analysis

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Co-infection of Parvovirus B19 and Plasmodium falciparum among Sickle Cell Disease Patients in Benin City, Nigeria

1 Moses-Otutu, I. M., 2 Okojie, R. O., 1* Akinbo, F. O., and 2 Eghafona, N. O.

1 Department of Medical Laboratory Science, School of Basic Medical Sciences, University of Benin, Benin City, Nigeria
2 Department of Microbiology, Faculty of Life Sciences, University of Benin, Benin City, Nigeria.
*Correspondence to: fgbengang@yahoo.com

Abstract:

Background: Infections by parasites, bacteria, viruses such as human parvovirus B19 amongst others, have been widely reported as contributing to high prevalence of anaemia in many populations. This study was conducted to determine the co-infection of Plasmodium falciparum and human parvovirus B19 among sickle cell disease (SCD) patients in Benin City, Edo State, Nigeria. Methodology: A total of 400 participants consisting 300 SCD patients (134 males, 166 females) and 100 (38 males, 62 females) apparently healthy subjects with haemoglobin AA (which served as control) who were contacted in homes, schools and offices, were enrolled for the study. The age of the participants ranged from 1 to 54 years. Venous blood was collected for detection of P. falciparum using Giemsa stain while parvovirus B19 was detected with enzyme linked immunosorbent assay (ELISA). Full blood count was estimated using Sysmex KX-21N haematology auto-analyzer. Results: An overall prevalence of parvovirus B19 and P. falciparum co-infection observed among SCD patients in this study was 3.0% while single infection was 14.0% for P. falciparum and 26.7% for parvovirus B19. Religion was associated with 0 to 22 fold increased risk of acquiring co-infection of P. falciparum and parvovirus B19. Gender was significantly associated with P. falciparum infection (p=0.0291) while tribal extraction, platelet index and seasonal variation were significantly associated with single parvovirus B19 or co-infection of P. falciparum and parvovirus B19 (p<0.05). Conclusion: The provision of strict regulatory policy concerning the screening of whole blood or pooled plasma before the use of blood products and transfusion of SCD patients is advocated.

Keywords: parvovirus B19, Benin City, P. falciparum, sickle cell disease

Received September 24, 2018; Revised May 14, 2019; Accepted May 15, 2019
Copyright 2019 AJCEM Open Access. This article is licensed and distributed under the terms of the Creative Commons Attrition 4.0 International License (//creativecommmons.org/licenses/by/4.0), which permits unrestricted use, distribution and reproduction in any medium, provided credit is given to the original author(s) and the source.

Co-infection par le parvovirus B19 et Plasmodium falciparum chez des patients atteints de drépanocytose à Benin City, au Nigéria

1 Moses-Otutu, I. M., 2 Okojie, R. O., 1* Akinbo, F. O., and 2 Eghafona, N. O.

1 Département des sciences de laboratoire médical, École des sciences médicales de base, Université du Bénin, Benin City, Nigéria

2 Département de microbiologie, faculté des sciences de la vie, Université du Bénin, Benin City, Nigéria

*Correspondance à: fgbengang@yahoo.com

Abstrait:

Contexte: Il a été largement rapporté que les infections par des parasites, des bactéries, des virus tels que le parvovirus humain B19, contribuent à la prévalence élevée de l’anémie dans de nombreuses populations. Cette étude visait à déterminer la co-infection de Plasmodium falciparum et du parvovirus humain B19 chez des patients atteints de drépanocytose à Benin City, dans l’État d’Edo, au Nigéria.
Méthodologie: Un total de 400 participants comprenant 300 patients atteints de MCA (134 hommes, 166 femmes) et 100 (38 hommes et 62 femmes) des sujets apparemment en bonne santé avec l’hémoglobine AA (qui servait de contrôle) qui ont été contactés à la maison, dans les écoles et au bureau inscrit à l’étude. L’âge des participants allait de 1 à 54 ans. Le sang veineux a été recueilli pour la détection de P. falciparum à l’aide de la coloration de Giemsa, tandis que le parvovirus B19 a été détecté par un test d’immunosorbant lié à une enzyme (ELISA). La numération globulaire totale a été estimée à l’aide de l’auto-analyseur d’hématologie Sysmex KX-21N.
Résultats: La prévalence globale de la co-infection au parvovirus B19 et à P. falciparum observée chez les patients atteints de MCs dans cette étude était de 3,0%, tandis que l’infection simple était de 14,0% pour P. falciparum et de 26,7% pour le parvovirus B19. La religion était associée à un risque accru de contracter la co-infection à P. falciparum et au parvovirus B19 de 0 à 22 fois plus élevé. Le sexe était significativement associé à l’infection à P. falciparum (p = 0,0291), tandis que l’extraction tribale, l’indice plaquettaire et la variation saisonnière étaient significativement associés à un parvovirus simple B19 ou à une co-infection à P. falciparum et au parvovirus B19 (p <0,05) Conclusion: La mise en place d’une politique réglementaire stricte concernant le dépistage du sang total ou du plasma réuni avant l’utilisation du produit sanguin et la transfusion de patients atteints de MCS est recommandée.

Mots-clés: parvovirus B19, Benin City, Plasmodium falciparum, drépanocytose

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Co-infection of Parvovirus B19 and Plasmodium falciparum among Sickle Cell Disease Patients in Benin City, Nigeria