Molecular characterization of extended spectrum beta-lactamase among clinical multidrug resistant Escherichia Coli in two hospitals of Niamey, Niger

A. M. Fody, T. S Bagré, A. K. Traoré, A Yacouba, R. Dembelé, L. Boubou, A. Inoussa, R. Sidikou, A. S. Traoré, A. Gassama-Sow, N. Barro

 

Abstract

Objective: The aim of this study was to identify the multiple ESBL genes in Multidrug-resistant (MDR) Escherichia coli isolated in various biological samples in two hospitals of Niamey.
Methodology: A total of 195 multidrug-resistant Escherichia coli were included in the study. These isolates were tested using polymerase chain reaction (PCR) for detection of the presence of bla CTX-M, bla TEM, bla SHV and bla OXA-1 beta-lactamase genes.
Results: A total of 27.7% of Escherichia coli isolates were ESBL producing strains. Globaly, the bla TEM gene was the most prevalent (70.3%) followed by bla CTX-M (43.1%), bla OXA-1 (31.8%) and bla SHV (4.1%) genes. The four genes type of ESBL were founded simultaneously only in stool samples. Furthermore, none bla SHV gene was found in other samples type.
Conclusion: This study showed the presence of various ESBL genes among clinical MDR Escherichia coli. That is why a rational use of antibiotic and appropriate methods of screening ESBL genes in routine laboratories in Niger is needed to control the ESBL genes dissemination.

Keywords: MDR ,Escherichia coli, ESBL, bla genes, PCR, Niamey, Niger.

 

Caracterisation moleculaire des betalactamases a spectre etendu chez les souches de Escherichia coli multi resistantes dans deux hopitaux de Niamey, au Niger

Objectifs: Le but de cette étude était d’identifier les multiples gènes de BLSE chez les souches de Escherichia coli multi résistantes isolées de différents types d’échantillons biologiques dans deux hôpitaux de Niamey.
Méthodologie : Un total de 195 Escherichia coli multi résistants a été inclus dans l’étude. Ces isolats ont été testés par la réaction de polymérase en chaîne (PCR) pour détecter la présence des gènes bla CTX-M, bla TEM, bla SHV et bla OXA-1.
Résultats : Au total, 27,7% des isolats de Escherichia coli multi-résistants étaient des souches productrices de BLSE. Globalement le gène blaTEM (70,3%) était le plus détecté suivi des autres gènes bla CTX-M (43,1%), bla OXA-1 (31,8%) et bla SHV (4,1%). Notons que seul dans les échantillons de selles quatre types de gènes de BLSE ont été trouvés simultanément. Par ailleurs notons qu’aucun gène de type bla SHV n’a été trouvé dans les autres types d’échantillons.
Conclusion : Cette étude avait montré la présence de divers gènes de BLSE chez les souches cliniques de Escherichia coli. C’est pourquoi une utilisation rationnelle des antibiotiques et des méthodes appropriées de dépistage des gènes de BLSE dans les laboratoires sont nécessaires afin de contrôler la diffusion des gènes de BLSE.

Mots clés : Escherichia coli multi résistantes, BLSE, gènes bla, PCR, Niamey, Niger

Download full journal in PDF below

Molecular characterization of extended spectrum beta-lactamase among clinical multidrug resistant Escherichia Coli in two hospitals of Niamey, Niger

In vitro antimicrobial activity of fermented spices and Capsicum Frutescens against multi drug resistance clinical isolate and standard reference bacteria

G. Ameya, A. Aklilu, N. Bisrat, M. Nassir, A Negash

 

Abstract

Introduction: Food preservation is required to maintain for a long period of time. Traditional organic food preservative, “Datta” is spice mainly made up of Chili Peppers which frequently used in southern and western part of Ethiopia. Datta can be consumed almost with every kind of foods and it is believed as appetizer and antimicrobial agent against food borne pathogen. This study aimed to assess in vitro antimicrobial activity of fermented condiment and Capsicum frutescens against multi drug resistance clinical isolate and standard reference bacteria.
Method: Datta samples collected from different level hotels and Capsicum frutescens (Chili peppers) were extractedin different solvents.Agar well diffusion assay was used to determine antimicrobial activity and minimum inhibitory concentration (MIC) and minimum bactericidal concentration was determined by tube dilution method. One way analysis of variant was used in comparison of the finding.
Results: Extracted fermented condiment (Datta) sample and Chili Pepper showed antimicrobial activities against multidrug resistant clinical isolate and standard reference bacteria in well diffusion assay. Datta extract showed MIC ranged from 25 mg/L to 66.7 mg/L and MBC ranged from 25 mg/L to 100 mg/L. The Datta and Chili pepper extracts showed high antimicrobial activities against standard Staphylococcus aureus. The water based extract of Datta sample were exhibited significantly low antimicrobial activities (P=0.000) as compared to the other extraction solvents.
Conclusion: Water was weak extractor of active compounds having antimicrobial activities. Reference S. aureuswasmore susceptible organism while ATCC Salmonella enteritidis and clinical isolated multi-drug resistant E. coli less susceptible. The traditional use of fermented condiment for food preservation by the local people is supported by this study.

Key words: Antimicrobial activity, Chili Pepper extract, Fermented condiment, Minimum bactericidal concentration, Minimum inhibition contraction

Activite antimicrobienne en vitro d’epices fermentees et de fruits de capsicume pour la resistance aux medicaments isolate clinique et bacteries de reference standard

Introduction: La conservation des aliments est nécessaire pour maintenir pendant une longue période de temps. Conservateur de nourriture organiqu et raditionnel, “Datta” est l’épicé compose principalement de Chili Peppers qui fréquemment utilize dans le sud et l’ouest de l’Ethiopie. Datta peu têtre consommé presque avec toutes sortes d’aliments et on le croit comme un apéritif et un agent antimicrobien contre l’agent pathogène alimentaire. Cette etude visait à évaluer l’activité antimicrobienne in vitro du condiment fermenté et Capsicum frutescens contre l’isolement clinique de résistance aux médicaments multiples et les bactéries de référence standard.
Méthode: Les échantillons de Datta prélevés dans des hôtels de différents niveaux et Capsicum frutescens (Chili Peppers) ont été extraits dans différents solvants. Un dosage de diffusion de puits a été utilisé pour determiner l’activité antimicrobienne et la concentration inhibitrice minimale (MIC) et la concentration bactericide minimale a été determine par la méthode de dilution du tube. Une analyse à sens unique de la variante a été utilisée en comparaison de la découverte.
Résultats: L’échantillon extrait de condiments fermentés (Datta) et Chili Pepper ont montré des activités antimicrobiennes contre l’isolement Clinique résistant aux médicaments multiples et les bactéries de référence standard dans le dosage par diffusion de puits. L’extrait de Datta a montréque le MIC variait de 25 mg / L à 66,7 mg / L et le MBC variait de 25 mg / L à 100 mg / L. Les extraits de poisson de Datta et de Chili ont montré des activités antimicrobiennes élevées contre Staphylococcus aureus standard. L’extrait à base d’eau de l’échantillon de Datta a montré des activités antimicrobiennes significativement faibles (P = 0,000) par rapport aux autres solvants d’extraction.
Conclusion: L’eauétaitun extracteur faible de composes actifs ayant des activités antimicrobiennes. Référence S. aureus était un organisme plus susceptible tandisque ATCC Salmonella enteritidis et E.coli. E. coli résistant aux médicaments multiples isolés était moins susceptible. L’utilisation traditionnelle du condiment fermenté pour la conservation des aliments par les populations locales est soutenue par cette étude.

Mots clés: Activitéantimicrobienne, Extrait de poivre de piment, Condiment fermenté, Concentration bactéricide minimum, Contraction minimaled’inhibition

Download full journal in PDF below

In vitro antimicrobial activity of fermented spices and Capsicum Frutescens against multi drug resistance clinical isolate and standard reference bacteria

Bacterial contamination of white coats and hands of healthcare workers at mansoura university children’s hospital, Mansoura-Egypt

N. S Gouda, A. M. Sultan, H. Eldegla, W.A Seliem

 

Abstract

Background: Transmission of hospital acquired infections (HAIs) may be associated with contamination of healthcare workers’ (HCWs) hands and white coats.
Objective: The purpose of this study was to clarify the role of HCWs’ white coats in transmitting HAIs and to determine the association between bacterial contamination of HCWs’ hands and white coats.
Methods: A total of 154 HCWs were enrolled in the study; different samples were taken from their hands and white coats. Samples were processed and both microbiological and biochemical characterization of the isolates were done using standard microbiological protocols.
Results: Up to 65.6% of hands and 61% of coats of HCWs were contaminated by microorganisms. Staphylococcus aureus was the most commonly isolated organisms from both hands and coats of HCWs (29.2%, 27.3% respectively) followed by MRSA (22.1%, 24.7% respectively).
Conclusions: The risk for contamination of hands and coats of HCWs is high in different clinical settings. In order to reduce the rate of HAIs, a strict dress protocol should be set into play to prevent cross contamination between HCWs and patients.

Keywords: contamination, HCWs, coat, hand, Staphylococcus aureus, MRSA.

 

Contamination bacterienne de manteaux blancs et de mains de soins de sante a l’hopital pour enfants de l’universite mansoura, Mansoura-Egypte

Contexte: La transmission des infections

Objectif: Le but de cette étude était de déterminer l’étendue, le type et l’association entre la contamination bactérienne des mains des travailleurs de la santé et les blouses blanches.

Méthodes: Au total, 154 travailleurs de la santé ont été inclus dans l’étude; différents échantillons ont été pris de leurs mains et des manteaux blancs. Les échantillons ont été traités et la caractérisation microbiologique et biochimique des isolats a été effectuée en utilisant des protocoles microbiologiques standard.

Résultats: Jusqu’à 65,6% des mains et 61% des couches de TS ont été contaminées par des micro-organismes. Le Staphylococcus aureusétait le plus souvent isolé des deux mains et des deux sexes (29,2%, 27,3%), suivi par le SARM (22,1%, 24,7% respectivement).

Conclusions: Le risque de contamination des mains et des couches de TS est élevé dans différents contextes cliniques. Afin de réduire le taux d’IASS, un protocole vestimentaire strict devrait être mis en place pour prévenir la contamination croisée entre les travailleurs de la santé et les patients.

Mots clés: contamination, agents de santé, manteau, main, Staphylococcus aureus, SARM

Download full journal in PDF below

Bacterial contamination of white coats and hands of healthcare workers at mansoura university children’s hospital, Mansoura-Egypt