Molecular characterization of Methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolates from a hospital in Ghana

2 Asante, J., 1 Govinden, U., 2 Owusu-Ofori, A., 3 Bester, L.A., and 1 Essack, S. Y.

1 Antimicrobial Research Unit, College of Health Sciences, University of KwaZulu Natal, Private Bag X54001, Durban, 4000, South Africa

2 Department of Clinical Microbiology, School of Medical Sciences, Kwame Nkrumah University of Science and Technology, Kumasi, Ghana

3 Biomedical Resource Unit, School of Laboratory Medicine and Medical Sciences, University of KwaZulu Natal, Durban, South Africa

*Correspondence to: josante33@yahoo.com

Abstract

Background: Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) are a major cause of hospital- and community-acquired infection. They can colonize humans and cause a wide range of infections including pneumonia, endocarditis and bacteraemia. We investigated the molecular mechanism of resistance and virulence of MRSA isolates from a teaching hospital in Ghana. Methodology: A total of 91 S. aureus isolates constituted the initial bacterial sample. Identification of S. aureus was confirmed by the VITEK 2 system. The cefoxitin screen test was used to detect MRSA and antibiotic susceptibility was determined using the VITEK 2 system. The resistance (mecA, blaZ, aac-aph, ermC, and tetK) and virulence (lukS/F-PV, hla, hld and eta) genes were amplified by polymerase chain reaction (PCR) and positive samples subjected to DNA sequencing. Pulsed field gel electrophoresis (PFGE) was used to ascertain the relatedness of the isolates.
Results: Fifty-eight of 91 (63.7%) isolates were putatively methicillin resistant by the phenotypic cefoxitin screen test and oxacillin MICs. However, 43 (47%) of the isolates were genotypically confirmed as MRSA based on PCR detection of the mecA gene. Furthermore, 37.9% of isolates displayed resistance to tetracycline, 19% to trimethoprim-sulphamethoxazole, 15.5% to clindamycin, 12.1% to gentamicin, 13.8% to ciprofloxacin and erythromycin, 6.9% to moxifloxacin and 7.0% to rifampicin. None of the isolates was positive for inducible clindamycin resistance. The prevalence of resistance (mecA, blaZ, aac(6’)-aph(2’’), tetK, and ermC) and virulence (hla and lukS/F-PV) genes respectively were 74%, 33%, 22%, 19%, 3%, 5% and 3%, with isolates organized in two highly related clades. Conclusion: Results indicate a fairly high occurrence of MRSA, which can complicate the effective therapy of S. aureus infections, necessitating surveillance and stringent infection control programmes to forestall its spread.

Keywords: MRSA, mecA, blaZ, hla, lukS/F-PV

Revised April 9, 2019; Accepted April 11, 2019

Copyright 2019 AJCEM Open Access. This article is licensed and distributed under the terms of the Creative Commons Attrition 4.0 International License (//creativecommmons.org/licenses/by/4.0), which permits unrestricted use, distribution and reproduction in any medium, provided credit is given to the original author(s) and the source.

 

Caractérisation moléculaire d’isolats de Staphylococcus aureus résistants à la méthicilline provenant d’un hôpital du Ghana

*1, 2 Asante, J., 1 Govinden, U., 2 Owusu-Ofori, A., 3 Bester, L., and 1 Essack, S. Y.

1 Unité de recherche antimicrobienne, Collège des sciences de la santé, Université du KwaZulu Natal, Sac privé X54001, Durban, 4000, Afrique du Sud.

2 Département de microbiologie clinique, Faculté des sciences médicales, Université des sciences et technologies Kwame Nkrumah, Kumasi, Ghana

3 Unité des ressources biomédicales, École de médecine de laboratoire et des sciences médicales, Université de KwaZulu Natal, Durban, Afrique du Sud

*Correspondance à: josante33@yahoo.com

Abstrait

Contexte: Le Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline (SARM) est une cause majeure d’infection acquise à l’hôpital et dans la communauté. Ils peuvent coloniser les humains et causer un large éventail d’infections, notamment la pneumonie, l’endocardite et la bactériémie. Nous avons étudié le mécanisme moléculaire de résistance et de virulence des isolats de SARM provenant d’un hôpital universitaire au Ghana. Méthodologie: Au total, 91 isolats de S. aureus constituaient l’échantillon bactérien initial. L’identification de S. aureus a été confirmée par le système VITEK 2. Le test de dépistage à la céfoxitine a été utilisé pour détecter le SARM et la sensibilité aux antibiotiques a été déterminée à l’aide du système VITEK 2. Les gènes de résistance (mecA, blaZ, aac-aph, ermC et tetK) et de virulence (lukS/F-PV, hla, hld et eta) ont été amplifiés par une réaction en chaîne de la polymérase (PCR) et des échantillons positifs soumis à un séquençage de l’ADN. Une électrophorèse sur gel en champ pulsé (PFGE) a été utilisée pour déterminer le caractère apparent des isolats. Résultats: Cinquante-huit des 91 isolats (63,7%) étaient présumés résistants à la méthicilline par le test de dépistage phénotypique à la céfoxitine et par les CMI oxacillines. Cependant, 43 (47%) des isolats ont été confirmés génotypiquement comme SARM sur la base de la détection par PCR du gène mecA. En outre, 37,9% des isolats présentaient une résistance à la tétracycline, 19% au triméthoprime-sulfaméthoxazole, 15,5% à la clindamycine, 12,1% à la gentamicine, 13,8% à la ciprofloxacine et à l’érythromycine, 6,9% à la moxifloxacine et 7,0% à la rifampicine. Aucun des isolats n’était positif pour la résistance inductible à la clindamycine. La prévalence des gènes de résistance (mecA, blaZ, aac(6′)-aph(2”), tetK et ermC) et de virulence (hla et lukS/F-PV) était respectivement de 74%, 33%, 22%, 19%, 3%, 5% et 3%, avec des isolats organisés en deux clades fortement apparentés. Conclusion: Les résultats indiquent une présence assez élevée de SARM, ce qui peut compliquer le traitement efficace des infections à S. aureus, nécessitant une surveillance et des programmes de contrôle des infections rigoureux pour prévenir sa propagation.

Mots-clés: SARM, mecA, blaZ, hla, lukS/F-PV

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Molecular characterization of Methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolates from a hospital in Ghana

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Supplementary AJCEM 1927 Phenotypic and Genotypic Characteristics of MRSA isolates

Supplementary AJCEM 1927 DNA Sequence Analysis

Co-infection of Parvovirus B19 and Plasmodium falciparum among Sickle Cell Disease Patients in Benin City, Nigeria

1 Moses-Otutu, I. M., 2 Okojie, R. O., 1* Akinbo, F. O., and 2 Eghafona, N. O.

1 Department of Medical Laboratory Science, School of Basic Medical Sciences, University of Benin, Benin City, Nigeria
2 Department of Microbiology, Faculty of Life Sciences, University of Benin, Benin City, Nigeria.
*Correspondence to: fgbengang@yahoo.com

Abstract:

Background: Infections by parasites, bacteria, viruses such as human parvovirus B19 amongst others, have been widely reported as contributing to high prevalence of anaemia in many populations. This study was conducted to determine the co-infection of Plasmodium falciparum and human parvovirus B19 among sickle cell disease (SCD) patients in Benin City, Edo State, Nigeria. Methodology: A total of 400 participants consisting 300 SCD patients (134 males, 166 females) and 100 (38 males, 62 females) apparently healthy subjects with haemoglobin AA (which served as control) who were contacted in homes, schools and offices, were enrolled for the study. The age of the participants ranged from 1 to 54 years. Venous blood was collected for detection of P. falciparum using Giemsa stain while parvovirus B19 was detected with enzyme linked immunosorbent assay (ELISA). Full blood count was estimated using Sysmex KX-21N haematology auto-analyzer. Results: An overall prevalence of parvovirus B19 and P. falciparum co-infection observed among SCD patients in this study was 3.0% while single infection was 14.0% for P. falciparum and 26.7% for parvovirus B19. Religion was associated with 0 to 22 fold increased risk of acquiring co-infection of P. falciparum and parvovirus B19. Gender was significantly associated with P. falciparum infection (p=0.0291) while tribal extraction, platelet index and seasonal variation were significantly associated with single parvovirus B19 or co-infection of P. falciparum and parvovirus B19 (p<0.05). Conclusion: The provision of strict regulatory policy concerning the screening of whole blood or pooled plasma before the use of blood products and transfusion of SCD patients is advocated.

Keywords: parvovirus B19, Benin City, P. falciparum, sickle cell disease

Received September 24, 2018; Revised May 14, 2019; Accepted May 15, 2019
Copyright 2019 AJCEM Open Access. This article is licensed and distributed under the terms of the Creative Commons Attrition 4.0 International License (//creativecommmons.org/licenses/by/4.0), which permits unrestricted use, distribution and reproduction in any medium, provided credit is given to the original author(s) and the source.

Co-infection par le parvovirus B19 et Plasmodium falciparum chez des patients atteints de drépanocytose à Benin City, au Nigéria

1 Moses-Otutu, I. M., 2 Okojie, R. O., 1* Akinbo, F. O., and 2 Eghafona, N. O.

1 Département des sciences de laboratoire médical, École des sciences médicales de base, Université du Bénin, Benin City, Nigéria

2 Département de microbiologie, faculté des sciences de la vie, Université du Bénin, Benin City, Nigéria

*Correspondance à: fgbengang@yahoo.com

Abstrait:

Contexte: Il a été largement rapporté que les infections par des parasites, des bactéries, des virus tels que le parvovirus humain B19, contribuent à la prévalence élevée de l’anémie dans de nombreuses populations. Cette étude visait à déterminer la co-infection de Plasmodium falciparum et du parvovirus humain B19 chez des patients atteints de drépanocytose à Benin City, dans l’État d’Edo, au Nigéria.
Méthodologie: Un total de 400 participants comprenant 300 patients atteints de MCA (134 hommes, 166 femmes) et 100 (38 hommes et 62 femmes) des sujets apparemment en bonne santé avec l’hémoglobine AA (qui servait de contrôle) qui ont été contactés à la maison, dans les écoles et au bureau inscrit à l’étude. L’âge des participants allait de 1 à 54 ans. Le sang veineux a été recueilli pour la détection de P. falciparum à l’aide de la coloration de Giemsa, tandis que le parvovirus B19 a été détecté par un test d’immunosorbant lié à une enzyme (ELISA). La numération globulaire totale a été estimée à l’aide de l’auto-analyseur d’hématologie Sysmex KX-21N.
Résultats: La prévalence globale de la co-infection au parvovirus B19 et à P. falciparum observée chez les patients atteints de MCs dans cette étude était de 3,0%, tandis que l’infection simple était de 14,0% pour P. falciparum et de 26,7% pour le parvovirus B19. La religion était associée à un risque accru de contracter la co-infection à P. falciparum et au parvovirus B19 de 0 à 22 fois plus élevé. Le sexe était significativement associé à l’infection à P. falciparum (p = 0,0291), tandis que l’extraction tribale, l’indice plaquettaire et la variation saisonnière étaient significativement associés à un parvovirus simple B19 ou à une co-infection à P. falciparum et au parvovirus B19 (p <0,05) Conclusion: La mise en place d’une politique réglementaire stricte concernant le dépistage du sang total ou du plasma réuni avant l’utilisation du produit sanguin et la transfusion de patients atteints de MCS est recommandée.

Mots-clés: parvovirus B19, Benin City, Plasmodium falciparum, drépanocytose

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Co-infection of Parvovirus B19 and Plasmodium falciparum among Sickle Cell Disease Patients in Benin City, Nigeria

Comparison of two diagnostic techniques to determine the prevalence of Schistosoma mansoni infections in Cameroonian school children

1 Sangue Soppa, N. P., 1 Mekam Nkengni, S. M., 1 Nguepnang, R. P., 2 Vignoles, P., 3,4 Tchuem-Tchuenté, L. A., and 1* Djuikwo Teukeng, F. F.
1 Faculty of Health Sciences, Campus of Banekane, Université des Montagnes, P. O. Box 208, Bangangté, Cameroon
2 INSERM U 1094, Institute of Neuroepidemiology and Tropical Neurology, 2, rue du Docteur Raymond Marcland, 87025 Limoges, France
3 Centre for Schistosomiasis and Parasitology, Texaco Omnisport, P. O. Box 7244, Yaoundé, Cameroon
4 Laboratory of Parasitology and Ecology, Faculty of Sciences, University of Yaoundé I, Yaoundé, Cameroon
*Correspondence to: ffnouboue@yahoo.fr

Abstract:
Background: The Kato-Katz technique is recommended for diagnosis of Schistosoma mansoni infection by the World Health Organization. However, egg counts are subject to variability. The aim of this study is to determine the prevalence of S. mansoni infection in school children using two different techniques and to recommend the technique that should be routinely used in the diagnosis of this infection.
Methodology: Field investigations on faecal samples from 299 Cameroonian school children were carried out in 2016 to compare the effectiveness of the Kato-Katz and Formalin-ether techniques in diagnosis of S. mansoni infections.
Results: Schistosome eggs were detected in 37 (12.3%) samples with the Kato-Katz technique and 61 (20.4%) samples with the Formalin-ether technique. The difference between the prevalence observed for the two techniques was significant in males and age group 10 – 12 years (p < 0.5).
Conclusion: The Formalin-ether technique was more sensitive than the Kato-Katz method for detecting S. mansoni eggs in faecal matter. Despite its cost, the Formalin-ether technique can be routinely used in the laboratory for epidemiological studies of intestinal schistosomiasis

Key words: Formalin-ether, Kato-Katz Schistosoma mansoni, school children

Received January 9, 2019; Revised March 14, 2019; Accepted March 28, 2019

Copyright 2019 AJCEM Open Access. This article is licensed and distributed under the terms of the Creative Commons Attrition 4.0 International License (//creativecommmons.org/licenses/by/4.0), which permits unrestricted use, distribution and reproduction in any medium, provided credit is given to the original author(s) and the source.

 

Comparaison de deux techniques de diagnostic pour déterminer la prévalence d’infections à Schistosoma mansoni chez des écoliers camerounais

1 Sangue Soppa, N. P., 1 Mekam Nkengni, S. M., 1Nguepnang, R. P., 2 Vignoles, P., 3,4 Tchuem-Tchuenté, L. A., and 1* Djuikwo Teukeng, F. F.

1 Faculté des sciences de la santé, Campus de Banekane, Université des Montagnes, P. O. Box 208, Bangangté, Cameroun
2 INSERM U 1094, Institut de Neuroépidémiologie et de neurologie tropicale, 2, rue du Docteur Raymond Marcland, 87025 Limoges, France
3 Centre pour la schistosomiase et la parasitologie, Texaco Omnisport, P. O. Box 7244, Yaoundé, Cameroun.
4 Laboratoire de parasitologie et d’écologie, Faculté des sciences, Université de Yaoundé I, Yaoundé, Cameroun *Correspondance à: ffnouboue@yahoo.fr

Résumé
Contexte: La méthode Kato-Katz est recommandée par l’Organisation mondiale de la santé pour le diagnostic de l’infection à Schistosoma mansoni. Cependant, le nombre d’oeufs est sujet à une variabilité. Le but de cette étude est de déterminer la prévalence de l’infection à S. mansoni chez les écoliers en utilisant deux techniques différentes et de recommander la technique à utiliser systématiquement pour le diagnostic de cette infection.
Méthodologie: Des enquêtes sur le terrain sur des échantillons de selles provenant de 299 écoliers camerounais ont été menées en 2016 pour comparer l’efficacité des techniques de Kato-Katz et au formol-éther dans le diagnostic des infections à S. mansoni.
Résultats: Des oeufs de schistosomes ont été détectés dans 37 échantillons (12,3%) avec la technique de Kato-Katz et 61 échantillons (20,4%) avec la technique au formol-éther. La différence entre la prévalence observée pour les deux techniques était significative chez les hommes et chez les 10-12 ans (p <0,5).
Conclusion: La technique au formol-éther était plus sensible que la méthode de Kato-Katz pour détecter les oeufs de S. mansoni dans les matières fécales. En dépit de son coût, la technique formol-éther peut être utilisée systématiquement en laboratoire pour des études épidémiologiques sur la schistosomiase intestinale.

Mots-clés: formol-éther, Kato-Katz, Schistosoma mansoni, écoliers

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Comparison of two diagnostic techniques to determine the prevalence of Schistosoma mansoni infections in Cameroonian school children