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Effect of physical stresses on survivability and post-exposure antibiotic susceptibility of coliforms in environmental waters and wastewaters

*Adebisi, O. O., Gbala, I. D., Akinsolu, F. T., and Olayemi, A. B.
Section of Integrative Bioenergetics Environmental and Ecotoxicological Systems, Department of Microbiology, Faculty of Life Sciences, University of Ilorin, P.M.B. 1515, Ilorin, Nigeria *Correspondence to: oo.adebisi@outlook.com; soji-olusegun@unilorin.edu.ng

Abstract:
Background: Coliform bacteria are majorly introduced into water bodies (river and wastewater) as a result of faecal pollution, agricultural run-offs and several anthropogenic activities. Despite the effectiveness of water treatment methods, pathogens still persist in water; hence the relevance of assessing the ability of these pathogens to survive the lethal actions of physical stresses and the possible impact on antibiotic susceptibility pattern of the organisms. Methodology: The survivability of Escherichia coli strains (NCM3722, FAP1 and ST2747), Enterobacter cloacae GGT036 and Shigella sonnei 53G was assessed in environmental and waste waters for 21 days. The effect of three treatment regimens (UV radiation, solar radiation and boiling) on the survival of the coliforms was evaluated. Also, the antibiogram of the isolates post–UV exposure was assayed. Results: Although there was significant reduction (≥ 3-log) in the population of the bacteria overtime, all the coliforms survived in the waters for 21 days. The effect of UV radiation was significant on all organisms (> 3 log reductions). Solar radiation for 60 minutes had significantly lesser effect than boiling for 15 minutes. Surviving cells of all isolates demonstrated multiple drug-resistance post exposure to UV radiation. Conclusion: This study revealed the ability of coliforms to persist in waters after treatment and proves that UV radiation may not be effective in attenuation of antibiotic resistance.

Keywords: Survivability; Coliforms; Antibiotic susceptibility; Water; Wastewater

Received December 17, 2018; Revised June 2, 2019; Accepted June 3, 2019
Copyright 2019 AJCEM Open Access. This article is licensed and distributed under the terms of the Creative Commons Attrition 4.0 International License (http://creativecommmons.org/licenses/by/4.0), which permits unrestricted use, distribution and reproduction in any medium, provided credit is given to the original author(s) and the source.

Effet des contraintes physiques sur la capacité de survie et la susceptibilité aux antibiotiques post-exposition aux coliformes dans les eaux de surface et les eaux usées

*Adebisi, O. O., Gbala, I. D., Akinsolu, F. T., et Olayemi, A. B.
Section de la bioénergétique intégrative Systèmes environnementaux et écotoxicologiques, Département de microbiologie, Faculté des sciences de la vie, Université d’Ilorin, P.M.B. 1515, Ilorin, Nigeria
*Correspondance à: oo.adebisi@outlook.com; soji-olusegun@unilorin.edu.ng

Abstrait:
Contexte: Les bactéries coliformes sont principalement introduites dans les eaux (rivières et eaux usées) en raison de la pollution fécale, des écoulements agricoles et de plusieurs activités anthropiques. Malgré l’efficacité des méthodes de traitement de l’eau, les agents pathogènes persistent dans l’eau; D’où la pertinence d’évaluer la capacité de ces agents pathogènes à survivre aux actions létales des stress physiques et à l’impact possible sur le profil de sensibilité des organismes aux antibiotiques. Méthodologie: La capacité de survie des souches d’Escherichia coli (NCM3722, FAP1 et ST2747), de Enterobacter cloacae GGT036 et de Shigella sonnei 53G a été évaluée pendant 21 jours dans des eaux environnementales et des eaux usées. L’effet de trois schémas thérapeutiques (rayonnement UV, rayonnement solaire et ébullition) sur la survie des coliformes a été évalué. En outre, l’antibiogramme des isolats après l’exposition aux UV a été testé.
Résultats: Bien qu’il y ait eu une réduction significative (≥ 3 log) de la population de bactéries en heures supplémentaires, tous les coliformes ont survécu dans les eaux pendant 21 jours. L’effet du rayonnement UV était significatif sur tous les organismes (réductions de> 3 log). Le rayonnement solaire pendant 60 minutes a eu un effet significativement moindre que celui d’ébullition pendant 15 minutes. Les cellules survivantes de tous les isolats ont démontré une résistance multiple aux médicaments après une exposition aux rayons UV.
Conclusion: cette étude a révélé la capacité des coliformes à persister dans les eaux après traitement et prouve que le rayonnement UV peut ne pas atténuer efficacement la résistance aux antibiotiques.

Mots-clés: Survivabilité; Les coliformes; Sensibilité aux antibiotiques; Eau; Eaux usées

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Effect of physical stresses on survivability and post-exposure antibiotic susceptibility of coliforms in environmental waters and wastewaters

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Phenotypic characterization of mycobacteria isolates from tuberculosis patients in Kaduna State, Nigeria

1,2Ahmadu, I., 1Olonitola, O. S., 1Suleiman, A. B., 3Lawan, M. K., and 4Makolo, D. 1Department of Microbiology, Faculty of Life Sciences, Ahmadu Bello University, Zaria, Nigeria 2National Tuberculosis Reference Laboratory, Zaria, Nigeria 3Department of Veterinary Public Health and Preventive Medicine, Faculty of Veterinary Medicine, Ahmadu Bello University, Zaria, Nigeria 4Department of Sciences, School of Preliminary Studies, Kogi State Polytechnic, Lokoja, Nigeria

Correspondence to: isiyakuadabka@yahoo.com Abstract: Background: Tuberculosis (TB) remains one of the leading public health challenges in Nigeria and the burden is still high. There is hence a need for continuous characterization of mycobacteria to obtain current data that will aid the ongoing TB prevention and control programme. The aim of this study was to phenotypically characterize mycobacteria isolates recovered from clinical specimens of patients with tuberculosis in Kaduna State, Nigeria.

Methods: Two thousand, two hundred and twelve (2212) sputum samples were collected from patients clinically suspected to have TB in three different zones of Kaduna State, Nigeria, between May 2017 and October, 2018. Samples were processed by decontaminating with NaOH-Citrate N-acetyl-L-Cystein method for Ziehl Neelsen (ZN) AFB microscopy and culture on Lowenstein Jensen (LJ) slants which were incubated at 37ᵒC for 8 weeks. Positive LJ cultures were further analyzed with a rapid TB antigen assay (SD-Bioline) to differentiate Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC) from Non Tuberculous Mycobacteria (NTM). Results: Out of the 2212 patients with suspected TB, 300 (13.6%) were positive for AFB by microscopy with Zone A (Kaduna North) having the highest AFB positive cases of 169 (15.2%). Of the 300 AFB positive samples, 272 (91.0%) were culture positive on LJ medium, 18 (6.0%) were culture negative and 10 (3.0%) were culture contaminated. Result of the distribution of mycobacteria among infected patients within the study area revealed that 219 (80.5%) were infected with MTBC, 42 (15.4%) with NTM and 11 (4.0%) with both MTBC and NTM. Conclusion: A relatively high number of TB in the study area was caused by NTM. There is need for advanced diagnostic tools that can differentiate MTBC and NTM strains among TB patients in all TB Reference Laboratories in Nigeria.

Keywords: Phenotypic, Characterization, Tuberculosis, Mycobacteria

Received May 25, 2019; Revised July 24, 2019; Accepted July 26, 2019
Copyright 2019 AJCEM Open Access. This article is licensed and distributed under the terms of the Creative Commons Attrition 4.0 International License (http://creativecommmons.org/licenses/by/4.0), which permits unrestricted use, distribution and reproduction in any medium, provided credit is given to the original author(s) and the source.

Caractérisation phénotypique d’isolats de mycobactéries provenant de patients atteints de tuberculose dans l’État de Kaduna, au Nigéria

1,2Ahmadu, I., 1Olonitola, O. S., 1Suleiman, A. B., 3Lawan, M. K., et 4Makolo, D.
1Département de microbiologie, Faculté des sciences de la vie, Université Ahmadu Bello, Zaria, Nigeria 2Laboratoire national de référence sur la tuberculose, Zaria, Nigéria 3Département de santé publique vétérinaire et de médecine préventive, Faculté de médecine vétérinaire, Université Ahmadu Bello, Zaria, Nigéria 4Département des sciences, École d’études préliminaires, École polytechnique d’État de Kogi, Lokoja, Nigéria Correspondance à: isiyakuadabka@yahoo.com

Abstrait:

Contexte: La tuberculose reste l’un des principaux problèmes de santé publique au Nigéria et le fardeau est encore lourd. Il est donc nécessaire de caractériser en permanence les mycobactéries pour obtenir les données actuelles qui aideront le programme de prévention et de contrôle de la tuberculose en cours. Le but de cette étude était de caractériser phénotypiquement les isolats de mycobactéries récupérés à partir d’échantillons cliniques de patients atteints de tuberculose dans l’État de Kaduna, au Nigéria. Méthodes: Deux mille douze cent douze (2212) échantillons d’expectorations ont été prélevés chez des patients cliniquement suspects de tuberculose dans trois zones différentes de l’État de Kaduna, au Nigéria, entre mai 2017 et octobre 2018. Les échantillons ont été traités par décontamination au NaOH-citrate. Méthode N-acétyl-L-Cystéine pour la microscopie AFB de Ziehl Neelsen (ZN) et culture sur des pentes de Lowenstein Jensen (LJ) qui ont été incubées à 37 ° C pendant 8 semaines. Les cultures de LJ positives ont ensuite été analysées avec un dosage rapide de l’antigène de la tuberculose (SD-Bioline) afin de différencier le complexe Mycobacterium tuberculosis (MTBC) des mycobactéries non tuberculeuses (NTM). Résultats: Sur les 2212 patients suspects de tuberculose, 300 (13,6%) étaient positifs pour AFB par microscopie, la zone A (Kaduna North) présentant le plus grand nombre de cas positifs avec 169 (15,2%). Sur les 300 échantillons AFB positifs, 272 (91,0%) étaient positifs en culture sur le milieu LJ, 18 (6,0%) étaient négatifs en culture et 10 (3,0%) étaient contaminés par la culture. Le résultat de la distribution des mycobactéries parmi les patients infectés dans la zone d’étude a révélé que 219 (80,5%) étaient infectés par le MTBC, 42 (15,4%) avec les NTM et 11 (4,0%) avec les deux types de MTBC. Conclusion: Un nombre relativement élevé de tuberculose dans la zone d’étude a été causée par les MNT. Il existe un besoin d’outils de diagnostic avancés permettant de différencier les souches de MTBC et de MNT parmi les patients atteints de tuberculose dans tous les laboratoires de référence pour la tuberculose au Nigeria.

Mots-clés: Phénotypique, Caractérisation, Tuberculose, Mycobactéries

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Phenotypic characterization of mycobacteria isolates from tuberculosis patients in Kaduna State, Nigeria

 

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Prevalence and antibiotic resistance profiles of extended spectrum β-lactamase-producing Escherichia coli among paediatric patients with urinary tract infection in St. Patricks’ Hospital, Mile Four, Abakaliki, Ebonyi State, Nigeria

Iroha, I. R., Onyia, U., *Moses, I. B., Ejikeugwu, C. P., Nwakaeze, A. E., and Ugbo, E. N.
Department of Applied Microbiology, Faculty of Sciences, Ebonyi State University, Abakaliki, Nigeria *Correspondence to: ben_iyke70@yahoo.com

Abstract:
Background: The extended spectrum beta-lactamase (ESBL)-producing Escherichia coli strains which have been implicated in septicaemia among hospitalized children is a serious concern due to their high resistance rates to commonly used antimicrobial agents. The objective of this study was to determine the prevalence and antibiotic susceptibility of urinary ESBL-producing E. coli in paediatric patients who had clinical evidence of urinary tract infections (UTI). Methodology: Clean catch specimens of urine collected from 100 eligible paediatric patients with clinical evidence of UTI in St. Patricks’ Hospital, Mile Four, Abakaliki, Ebonyi State, were cultured for isolation of E. coli using standard bacteriological techniques. Isolates were confirmed for ESBL production by double disk synergy test (DDST), and antibiotic susceptibility of the ESBL-producing ones was determined by the modified Kirby Bauer disk diffusion method. Results: Twenty one (21%) E. coli were isolated out of which 11 (52 %) were ESBL producers, all of which were totally resistant (100%) to cefotaxime, ticarcillin and sulfamethoxazole-trimethoprim, 85% to aztreonam and 83% to ceftazidime. The multiple antibiotic resistance index (MARI) values ranged from 0.4 to 0.9, which implies high usage of antimicrobials Conclusion: The high prevalence of multi-drug resistant ESBL-producing E. coli obtained in this study shows that there has been overuse (abuse or misuse) of antibiotics in the study area. There is need for antimicrobial stewardship programme that will ensure prudent use of antimicrobial agents to forestall the emergence and spread of multi-drug resistant bacteria.

Keywords: Paediatrics, Escherichia coli, ESBL, urine, multi-drug resistance

Received February 8, 2019; Revised May 23, 2019; Accepted May 24, 2019
Copyright 2019 AJCEM Open Access. This article is licensed and distributed under the terms of the Creative Commons Attrition 4.0 International License (http://creativecommmons.org/licenses/by/4.0), which permits unrestricted use, distribution and reproduction in any medium, provided credit is given to the original author(s) and the source.

Profils de prévalence et de résistance aux antibiotiques d’Escherichia coli produisant des β-lactamases à spectre étendu chez des patients pédiatriques présentant une infection des voies urinaires à l’hôpital St. Patricks, Mile Four, Abakaliki, État d’Ebonyi, Nigéria

Iroha, I. R., Onyia, U. * Moses, I. B., Ejikeugwu, C. P., Nwakaeze, A. E., et Ugbo, E. N.
Département de microbiologie appliquée, Faculté des sciences, Université d’Ebonyi, Abakaliki, Nigéria *Correspondance à: ben_iyke70@yahoo.com

Abstrait:
Contexte: Les souches d’Escherichia coli productrices de bêta-lactamase à spectre étendu (BLSE) qui ont été impliquées dans la septicémie chez les enfants hospitalisés constituent un grave problème en raison de leur taux de résistance élevé aux agents antimicrobiens couramment utilisés. L’objectif de cette étude était de déterminer la prévalence et la sensibilité aux antibiotiques d’E. coli producteurs de BLSE dans l’urine chez les patients pédiatriques présentant des signes cliniques d’infections des voies urinaires (UTI). Méthodologie: Des échantillons d’urine prélevés chez 100 patients pédiatriques éligibles présentant des signes cliniques d’UTI à l’hôpital St. Patricks, à Mile Four, à Abakaliki, dans l’État d’Ebonyi, ont été cultivés pour l’isolement de E. coli à l’aide de techniques bactériologiques classiques. Les isolats ont été confirmés pour la production de BLSE par un test de synergie à double disque (DDST) et la sensibilité aux antibiotiques des producteurs de BLSE a été déterminée par la méthode de diffusion sur disque de Kirby Bauer modifiée. Résultats: Vingt et un (21%) E. coli ont été isolés, dont 11 (52%) étaient des producteurs de BLSE, qui étaient tous totalement résistants (100%) au céfotaxime, à la ticarcilline et au sulfaméthoxazole-triméthoprime, 85% à l’aztréonam et au 83 % en ceftazidime. Les valeurs de l’indice de résistance multiple aux antibiotiques (MARI) allaient de 0,4 à 0,9, ce qui implique une utilisation élevée d’antimicrobiens Conclusion: La prévalence élevée d’E. coli productrice de BLSE résistante à plusieurs médicaments obtenue dans cette étude montre qu’il y a eu surutilisation (abus ou abus). ) d’antibiotiques dans la zone d’étude. Un programme de gestion des antimicrobiens est nécessaire pour garantir une utilisation prudente des agents antimicrobiens afin de prévenir l’émergence et la propagation de bactéries multirésistantes aux médicaments

Mots-clés: pédiatrie, Escherichia coli, BLSE, urine, multirésistance

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Prevalence and antibiotic resistance profiles of extended spectrum β-lactamase-producing Escherichia coli among paediatric patients with urinary tract infection in St. Patricks’ Hospital, Mile Four, Abakaliki, Ebonyi State, Nigeria

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Prevalence of HIV infection among newly admitted students in Ebonyi State University, Abakaliki, Nigeria

*Nworie, A., Kalu, M. E., Usanga, V. U., and Ibe, O. E.
Department of Medical Laboratory Science, Ebonyi State University, Abakaliki, Nigeria
*Correspondence to: nworieamos@gmail.com; Mobile: +2348100226465

Abstract:
Background: Human immunodeficiency virus (HIV) and the associated acquired immune deficiency syndrome (AIDS) have remained a serious scourge and a major public health concern, affecting millions in sub-Saharan Africa despite awareness campaigns, preventive measures and promotion of antiretroviral regimens. This study determined the prevalence of HIV among newly admitted students of Ebonyi State University as a measure of the impact of awareness campaign towards prevention of HIV transmission.
Methods: Newly admitted students of Ebonyi State University totalling 2,736 who voluntarily enrolled for the study were screened for HIV infection using the national HIV testing algorithm after information relating to their personal lifestyle, knowledge of safer sex and preventive measures have been obtained with the use of a client intake form.
Results: Of the 2,736 subjects screened, 6 were positive for HIV, giving a prevalence rate of 0.22%, with prevalence rate of 0.29% (4 of 1344) in females and 0.14% (2 of 1392) in males (X2=0.2041, p=0.6514). The positive subjects were spread across age groups 15-19 years (1), 20-24 years (4) and 25-29 years (1). Males and females who have had sex were 801 and 579 out of which 239 and 209 respectively acknowledged to have had unprotected sex within three months of the study.
Conclusion: The low HIV prevalence rate of 0.22% among school age and young adults in this study may indicate that awareness and safe sex campaigns in Ebonyi State have positive impact in HIV prevention amongst these groups of people.

Keywords: HIV, students, Ebonyi State University, Nigeria, prevalence, campaign

Received May 19, 2019; Revised July 15, 2019; Accepted July 16, 2019
Copyright 2019 AJCEM Open Access. This article is licensed and distributed under the terms of the Creative Commons Attrition 4.0 International License (http://creativecommmons.org/licenses/by/4.0), which permits unrestricted use, distribution and reproduction in any medium, provided credit is given to the original author(s) and the source.

Prévalence de l’infection à VIH chez les étudiants nouvellement admis à l’Université d’Ebonyi, Abakaliki, Nigéria

*Nworie, A., Kalu, M. E., Usanga, V. U., et Ibe, O. E.
Département des sciences de laboratoire médical, université d’État Ebonyi, Abakaliki, Nigéria
*Correspondance à: nworieamos@gmail.com; Mobile: +2348100226465

Abstrait:
Contexte: le virus de l’immunodéficience humaine (VIH) et le syndrome d’immunodéficience acquise (SIDA) associé restent un grave fléau et un grave problème de santé publique, touchant des millions de personnes en Afrique subsaharienne en dépit des campagnes de sensibilisation, des mesures préventives et de la promotion des schémas thérapeutiques antirétroviraux. Cette étude a déterminé la prévalence du VIH parmi les étudiants nouvellement admis à l’Université d’Ebonyi en tant que mesure de l’impact de la campagne de sensibilisation sur la prévention de la transmission du VIH.
Méthodes: Les étudiants nouvellement admis à l’Université d’Ebonyi, sur un total de 2 736 inscrits volontairement à l’étude, ont été dépistés pour l’infection à VIH à l’aide de l’algorithme national de dépistage du VIH, après que des informations relatives à leur mode de vie personnel, à leur connaissance du sexe sans risque et à des un formulaire d’admission du client.
Résultats: Sur les 2 736 sujets dépistés, 6 étaient séropositifs, soit un taux de prévalence de 0,22%, avec un taux de prévalence de 0,29% (4 sur 1344) chez les femmes et de 0,14% (2 sur 1392) chez les hommes (X2 = 0,2041, p = 0,6514). Les sujets positifs étaient répartis dans les groupes d’âge 15-19 ans (1), 20-24 ans (4) et 25-29 ans (1). Les hommes et les femmes ayant eu des rapports sexuels comptaient 801 et 579 personnes, dont 239 et 209 respectivement ont reconnu avoir eu des rapports sexuels non protégés dans les trois mois suivant l’étude.
Conclusion: Le faible taux de prévalence du VIH de 0,22% chez les enfants d’âge scolaire et les jeunes adultes dans cette étude peut indiquer que les campagnes de sensibilisation et de promotion du sexe sans risque dans l’État d’Ebonyi ont un impact positif sur la prévention du VIH parmi ces groupes de personnes

Mots-clés: VIH, étudiants, université d’Ebonyi, Nigéria, prévalence, campagne

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Prevalence of HIV infection among newly admitted students in Ebonyi State University, Abakaliki, Nigeria

 

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Bacteriological profiles of acute suppurative otitis media in children in Brazzaville, Congo

1Otouana Dzon, H. B., 1Ngouoni, G. C., 2Diembi, S., 1Tsierie-Tsoba, A., 3Kambourou, J., 1Itiere-Odzili, F. A., and 1Ondzotto, G. 1Otolaryngology Department, Brazzaville University Hospital Center, BP 13356, Congo
2Otolaryngology Department, General Hospital, Adolph Sicé, Congo 3Paediatric Intensive Care Department, Brazzaville University Hospital Center, Congo
Correspondence to: hb.otouana@gmail.com; (00242) 069422411

Abstract:

Background: Acute suppurative otitis media (ASOM) is one of the main indications for antibiotic prescription in children. The close proximity of the middle ear to the brain and the increasing resistance of microbial organisms involved in otitis media make this pathology of great concern in children. The objective of this study is to determine the bacteriological profile of acute otitis media in Congo as a guide to the choice of antibiotics for empirical therapy. Methodology: A cross sectional study of children less than 17 years old with acute suppurative otitis media in the otorhinolaryngology service of the Brazzaville University Hospital, Congo, was conducted over a 14 month period. All subjects whose samples were sterile or contaminated (poly-microbial culture) and those who received antibiotic-corticosteroid therapy were excluded. The identification of bacteria to species level was done using conventional biochemical identification tests scheme. Antibiotic sensitivity was performed on isolates using the modified Bauer Kirby disk diffusion test on plain Mueller Hinton (MH) agar and MH agar with 5% horse blood. Results: Four bacteria families/species were identified; Staphylococcus aureus (32.7%), family Enterobacteriaceae (28.6%), Streptococcus pneumoniae (26.5%) and Pseudomonas aeruginosa (12.2%). Ps. aeruginosa was associated with greenish otorrhea while S. aureus, Enterobacteriaceae and S. pneumoniae were associated with yellowish otorrhea (p = 0.001). Conclusion: The bacterial aetiology of acute suppurative otitis media varies from country to country. In Congo, this study reports four main bacteria families/species involved in acute otitis media with high resistance to β-lactam antibiotics but high sensitivity to macrolides and fluoroquinolones.

Key words: otitis; child; antibiogram; bacteria; Brazzaville

Received March 25, 2019; Revised June 11, 2019; Accepted June 12, 2019
Copyright 2019 AJCEM Open Access. This article is licensed and distributed under the terms of the Creative Commons Attrition 4.0 International License (http://creativecommmons.org/licenses/by/4.0), which permits unrestricted use, distribution and reproduction in any medium, provided credit is given to the original author(s) and the source.

Profils bactériologiques de l’otite moyenne suppurative aiguë chez les enfants à Brazzaville, Congo

1Otouana Dzon, H. B., 1Ngouoni, G. C., 2Diembi, S., 1Since-Tsoba, A., 3Kambourou, J.,
1Itiere-Odzili, F. A., et 1Ondzotto, G.
1 Département d’oto-rhino-laryngologie, Centre hospitalier universitaire de Brazzaville, BP 13356, Congo
2 Département d’oto-rhino-laryngologie, Hôpital général, Adolph Sicé, Congo
3 Service de soins intensifs pédiatriques, Centre hospitalier universitaire de Brazzaville, Congo
Correspondance à: hb.otouana@gmail.com; (00242) 069422411

Abstrait:
Contexte: L’otite moyenne suppurative aiguë est l’une des principales indications de la prescription d’antibiotiques chez les enfants. La proximité de l’oreille moyenne au cerveau et la résistance croissante des organismes microbiens impliqués dans l’otite moyenne rendent cette pathologie extrêmement préoccupante chez les enfants. L’objectif de cette étude est de déterminer le profil bactériologique de l’otite moyenne aiguë au Congo en tant que guide pour le choix des antibiotiques pour un traitement empirique.
Méthodologie: Une étude transversale sur les enfants de moins de 17 ans atteints d’otite moyenne suppurée aiguë dans le service d’otorhinolaryngologie de l’hôpital universitaire de Brazzaville au Congo a été menée sur une période de 14 mois. Tous les sujets dont les échantillons étaient stériles ou contaminés (culture poly-microbienne) et ceux ayant reçu un traitement antibiotique-corticostéroïde ont été exclus. L’identification des bactéries au niveau de l’espèce a été réalisée à l’aide d’un programme d’essais d’identification biochimique conventionnel. La sensibilité aux antibiotiques a été réalisée sur des isolats en utilisant les tests de diffusion sur disque Bauer Kirby modifiés sur gélose Mueller Hinton (MH) et gélose MH avec 5% de sang de cheval. Résultats: Quatre familles/espèces de bactéries ont été identifiées. Staphylococcus aureus (32,7%), la famille des Enterobacteriaceae (28,6%), Streptococcus pneumoniae (26,5%) et Pseudomonas aeruginosa (12,2%). Ps. aeruginosa était associé à une otorrhée verdâtre, alors que S. aureus, Enterobacteriaceae et S. pneumoniae étaient associés à une otorrhée jaunâtre (p = 0,001). Conclusion: L’étiologie bactérienne de l’otite moyenne suppurée aiguë varie d’un pays à l’autre. Au Congo, cette étude fait état de quatre familles / espèces de bactéries principales impliquées dans les otites moyennes aiguës présentant une résistance élevée aux antibiotiques β-lactames mais une sensibilité élevée aux macrolides et aux fluoroquinolones.

Mots-clés: otite; enfant; antibiogramme; les bactéries; Congo Brazzaville

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Bacteriological profiles of acute suppurative otitis media in children in Brazzaville, Congo

 

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Molecular characterization of Methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolates from a hospital in Ghana

2 Asante, J., 1 Govinden, U., 2 Owusu-Ofori, A., 3 Bester, L.A., and 1 Essack, S. Y.

1 Antimicrobial Research Unit, College of Health Sciences, University of KwaZulu Natal, Private Bag X54001, Durban, 4000, South Africa

2 Department of Clinical Microbiology, School of Medical Sciences, Kwame Nkrumah University of Science and Technology, Kumasi, Ghana

3 Biomedical Resource Unit, School of Laboratory Medicine and Medical Sciences, University of KwaZulu Natal, Durban, South Africa

*Correspondence to: josante33@yahoo.com

Abstract

Background: Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) are a major cause of hospital- and community-acquired infection. They can colonize humans and cause a wide range of infections including pneumonia, endocarditis and bacteraemia. We investigated the molecular mechanism of resistance and virulence of MRSA isolates from a teaching hospital in Ghana. Methodology: A total of 91 S. aureus isolates constituted the initial bacterial sample. Identification of S. aureus was confirmed by the VITEK 2 system. The cefoxitin screen test was used to detect MRSA and antibiotic susceptibility was determined using the VITEK 2 system. The resistance (mecA, blaZ, aac-aph, ermC, and tetK) and virulence (lukS/F-PV, hla, hld and eta) genes were amplified by polymerase chain reaction (PCR) and positive samples subjected to DNA sequencing. Pulsed field gel electrophoresis (PFGE) was used to ascertain the relatedness of the isolates.
Results: Fifty-eight of 91 (63.7%) isolates were putatively methicillin resistant by the phenotypic cefoxitin screen test and oxacillin MICs. However, 43 (47%) of the isolates were genotypically confirmed as MRSA based on PCR detection of the mecA gene. Furthermore, 37.9% of isolates displayed resistance to tetracycline, 19% to trimethoprim-sulphamethoxazole, 15.5% to clindamycin, 12.1% to gentamicin, 13.8% to ciprofloxacin and erythromycin, 6.9% to moxifloxacin and 7.0% to rifampicin. None of the isolates was positive for inducible clindamycin resistance. The prevalence of resistance (mecA, blaZ, aac(6’)-aph(2’’), tetK, and ermC) and virulence (hla and lukS/F-PV) genes respectively were 74%, 33%, 22%, 19%, 3%, 5% and 3%, with isolates organized in two highly related clades. Conclusion: Results indicate a fairly high occurrence of MRSA, which can complicate the effective therapy of S. aureus infections, necessitating surveillance and stringent infection control programmes to forestall its spread.

Keywords: MRSA, mecA, blaZ, hla, lukS/F-PV

Revised April 9, 2019; Accepted April 11, 2019

Copyright 2019 AJCEM Open Access. This article is licensed and distributed under the terms of the Creative Commons Attrition 4.0 International License (http://creativecommmons.org/licenses/by/4.0), which permits unrestricted use, distribution and reproduction in any medium, provided credit is given to the original author(s) and the source.

 

Caractérisation moléculaire d’isolats de Staphylococcus aureus résistants à la méthicilline provenant d’un hôpital du Ghana

*1, 2 Asante, J., 1 Govinden, U., 2 Owusu-Ofori, A., 3 Bester, L., and 1 Essack, S. Y.

1 Unité de recherche antimicrobienne, Collège des sciences de la santé, Université du KwaZulu Natal, Sac privé X54001, Durban, 4000, Afrique du Sud.

2 Département de microbiologie clinique, Faculté des sciences médicales, Université des sciences et technologies Kwame Nkrumah, Kumasi, Ghana

3 Unité des ressources biomédicales, École de médecine de laboratoire et des sciences médicales, Université de KwaZulu Natal, Durban, Afrique du Sud

*Correspondance à: josante33@yahoo.com

Abstrait

Contexte: Le Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline (SARM) est une cause majeure d’infection acquise à l’hôpital et dans la communauté. Ils peuvent coloniser les humains et causer un large éventail d’infections, notamment la pneumonie, l’endocardite et la bactériémie. Nous avons étudié le mécanisme moléculaire de résistance et de virulence des isolats de SARM provenant d’un hôpital universitaire au Ghana. Méthodologie: Au total, 91 isolats de S. aureus constituaient l’échantillon bactérien initial. L’identification de S. aureus a été confirmée par le système VITEK 2. Le test de dépistage à la céfoxitine a été utilisé pour détecter le SARM et la sensibilité aux antibiotiques a été déterminée à l’aide du système VITEK 2. Les gènes de résistance (mecA, blaZ, aac-aph, ermC et tetK) et de virulence (lukS/F-PV, hla, hld et eta) ont été amplifiés par une réaction en chaîne de la polymérase (PCR) et des échantillons positifs soumis à un séquençage de l’ADN. Une électrophorèse sur gel en champ pulsé (PFGE) a été utilisée pour déterminer le caractère apparent des isolats. Résultats: Cinquante-huit des 91 isolats (63,7%) étaient présumés résistants à la méthicilline par le test de dépistage phénotypique à la céfoxitine et par les CMI oxacillines. Cependant, 43 (47%) des isolats ont été confirmés génotypiquement comme SARM sur la base de la détection par PCR du gène mecA. En outre, 37,9% des isolats présentaient une résistance à la tétracycline, 19% au triméthoprime-sulfaméthoxazole, 15,5% à la clindamycine, 12,1% à la gentamicine, 13,8% à la ciprofloxacine et à l’érythromycine, 6,9% à la moxifloxacine et 7,0% à la rifampicine. Aucun des isolats n’était positif pour la résistance inductible à la clindamycine. La prévalence des gènes de résistance (mecA, blaZ, aac(6′)-aph(2”), tetK et ermC) et de virulence (hla et lukS/F-PV) était respectivement de 74%, 33%, 22%, 19%, 3%, 5% et 3%, avec des isolats organisés en deux clades fortement apparentés. Conclusion: Les résultats indiquent une présence assez élevée de SARM, ce qui peut compliquer le traitement efficace des infections à S. aureus, nécessitant une surveillance et des programmes de contrôle des infections rigoureux pour prévenir sa propagation.

Mots-clés: SARM, mecA, blaZ, hla, lukS/F-PV

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Molecular characterization of Methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolates from a hospital in Ghana

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Supplementary AJCEM 1927 Phenotypic and Genotypic Characteristics of MRSA isolates

Supplementary AJCEM 1927 DNA Sequence Analysis

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Co-infection of Parvovirus B19 and Plasmodium falciparum among Sickle Cell Disease Patients in Benin City, Nigeria

1 Moses-Otutu, I. M., 2 Okojie, R. O., 1* Akinbo, F. O., and 2 Eghafona, N. O.

1 Department of Medical Laboratory Science, School of Basic Medical Sciences, University of Benin, Benin City, Nigeria
2 Department of Microbiology, Faculty of Life Sciences, University of Benin, Benin City, Nigeria.
*Correspondence to: fgbengang@yahoo.com

Abstract:

Background: Infections by parasites, bacteria, viruses such as human parvovirus B19 amongst others, have been widely reported as contributing to high prevalence of anaemia in many populations. This study was conducted to determine the co-infection of Plasmodium falciparum and human parvovirus B19 among sickle cell disease (SCD) patients in Benin City, Edo State, Nigeria. Methodology: A total of 400 participants consisting 300 SCD patients (134 males, 166 females) and 100 (38 males, 62 females) apparently healthy subjects with haemoglobin AA (which served as control) who were contacted in homes, schools and offices, were enrolled for the study. The age of the participants ranged from 1 to 54 years. Venous blood was collected for detection of P. falciparum using Giemsa stain while parvovirus B19 was detected with enzyme linked immunosorbent assay (ELISA). Full blood count was estimated using Sysmex KX-21N haematology auto-analyzer. Results: An overall prevalence of parvovirus B19 and P. falciparum co-infection observed among SCD patients in this study was 3.0% while single infection was 14.0% for P. falciparum and 26.7% for parvovirus B19. Religion was associated with 0 to 22 fold increased risk of acquiring co-infection of P. falciparum and parvovirus B19. Gender was significantly associated with P. falciparum infection (p=0.0291) while tribal extraction, platelet index and seasonal variation were significantly associated with single parvovirus B19 or co-infection of P. falciparum and parvovirus B19 (p<0.05). Conclusion: The provision of strict regulatory policy concerning the screening of whole blood or pooled plasma before the use of blood products and transfusion of SCD patients is advocated.

Keywords: parvovirus B19, Benin City, P. falciparum, sickle cell disease

Received September 24, 2018; Revised May 14, 2019; Accepted May 15, 2019
Copyright 2019 AJCEM Open Access. This article is licensed and distributed under the terms of the Creative Commons Attrition 4.0 International License (http://creativecommmons.org/licenses/by/4.0), which permits unrestricted use, distribution and reproduction in any medium, provided credit is given to the original author(s) and the source.

Co-infection par le parvovirus B19 et Plasmodium falciparum chez des patients atteints de drépanocytose à Benin City, au Nigéria

1 Moses-Otutu, I. M., 2 Okojie, R. O., 1* Akinbo, F. O., and 2 Eghafona, N. O.

1 Département des sciences de laboratoire médical, École des sciences médicales de base, Université du Bénin, Benin City, Nigéria

2 Département de microbiologie, faculté des sciences de la vie, Université du Bénin, Benin City, Nigéria

*Correspondance à: fgbengang@yahoo.com

Abstrait:

Contexte: Il a été largement rapporté que les infections par des parasites, des bactéries, des virus tels que le parvovirus humain B19, contribuent à la prévalence élevée de l’anémie dans de nombreuses populations. Cette étude visait à déterminer la co-infection de Plasmodium falciparum et du parvovirus humain B19 chez des patients atteints de drépanocytose à Benin City, dans l’État d’Edo, au Nigéria.
Méthodologie: Un total de 400 participants comprenant 300 patients atteints de MCA (134 hommes, 166 femmes) et 100 (38 hommes et 62 femmes) des sujets apparemment en bonne santé avec l’hémoglobine AA (qui servait de contrôle) qui ont été contactés à la maison, dans les écoles et au bureau inscrit à l’étude. L’âge des participants allait de 1 à 54 ans. Le sang veineux a été recueilli pour la détection de P. falciparum à l’aide de la coloration de Giemsa, tandis que le parvovirus B19 a été détecté par un test d’immunosorbant lié à une enzyme (ELISA). La numération globulaire totale a été estimée à l’aide de l’auto-analyseur d’hématologie Sysmex KX-21N.
Résultats: La prévalence globale de la co-infection au parvovirus B19 et à P. falciparum observée chez les patients atteints de MCs dans cette étude était de 3,0%, tandis que l’infection simple était de 14,0% pour P. falciparum et de 26,7% pour le parvovirus B19. La religion était associée à un risque accru de contracter la co-infection à P. falciparum et au parvovirus B19 de 0 à 22 fois plus élevé. Le sexe était significativement associé à l’infection à P. falciparum (p = 0,0291), tandis que l’extraction tribale, l’indice plaquettaire et la variation saisonnière étaient significativement associés à un parvovirus simple B19 ou à une co-infection à P. falciparum et au parvovirus B19 (p <0,05) Conclusion: La mise en place d’une politique réglementaire stricte concernant le dépistage du sang total ou du plasma réuni avant l’utilisation du produit sanguin et la transfusion de patients atteints de MCS est recommandée.

Mots-clés: parvovirus B19, Benin City, Plasmodium falciparum, drépanocytose

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Co-infection of Parvovirus B19 and Plasmodium falciparum among Sickle Cell Disease Patients in Benin City, Nigeria

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Comparison of two diagnostic techniques to determine the prevalence of Schistosoma mansoni infections in Cameroonian school children

1 Sangue Soppa, N. P., 1 Mekam Nkengni, S. M., 1 Nguepnang, R. P., 2 Vignoles, P., 3,4 Tchuem-Tchuenté, L. A., and 1* Djuikwo Teukeng, F. F.
1 Faculty of Health Sciences, Campus of Banekane, Université des Montagnes, P. O. Box 208, Bangangté, Cameroon
2 INSERM U 1094, Institute of Neuroepidemiology and Tropical Neurology, 2, rue du Docteur Raymond Marcland, 87025 Limoges, France
3 Centre for Schistosomiasis and Parasitology, Texaco Omnisport, P. O. Box 7244, Yaoundé, Cameroon
4 Laboratory of Parasitology and Ecology, Faculty of Sciences, University of Yaoundé I, Yaoundé, Cameroon
*Correspondence to: ffnouboue@yahoo.fr

Abstract:
Background: The Kato-Katz technique is recommended for diagnosis of Schistosoma mansoni infection by the World Health Organization. However, egg counts are subject to variability. The aim of this study is to determine the prevalence of S. mansoni infection in school children using two different techniques and to recommend the technique that should be routinely used in the diagnosis of this infection.
Methodology: Field investigations on faecal samples from 299 Cameroonian school children were carried out in 2016 to compare the effectiveness of the Kato-Katz and Formalin-ether techniques in diagnosis of S. mansoni infections.
Results: Schistosome eggs were detected in 37 (12.3%) samples with the Kato-Katz technique and 61 (20.4%) samples with the Formalin-ether technique. The difference between the prevalence observed for the two techniques was significant in males and age group 10 – 12 years (p < 0.5).
Conclusion: The Formalin-ether technique was more sensitive than the Kato-Katz method for detecting S. mansoni eggs in faecal matter. Despite its cost, the Formalin-ether technique can be routinely used in the laboratory for epidemiological studies of intestinal schistosomiasis

Key words: Formalin-ether, Kato-Katz Schistosoma mansoni, school children

Received January 9, 2019; Revised March 14, 2019; Accepted March 28, 2019

Copyright 2019 AJCEM Open Access. This article is licensed and distributed under the terms of the Creative Commons Attrition 4.0 International License (http://creativecommmons.org/licenses/by/4.0), which permits unrestricted use, distribution and reproduction in any medium, provided credit is given to the original author(s) and the source.

 

Comparaison de deux techniques de diagnostic pour déterminer la prévalence d’infections à Schistosoma mansoni chez des écoliers camerounais

1 Sangue Soppa, N. P., 1 Mekam Nkengni, S. M., 1Nguepnang, R. P., 2 Vignoles, P., 3,4 Tchuem-Tchuenté, L. A., and 1* Djuikwo Teukeng, F. F.

1 Faculté des sciences de la santé, Campus de Banekane, Université des Montagnes, P. O. Box 208, Bangangté, Cameroun
2 INSERM U 1094, Institut de Neuroépidémiologie et de neurologie tropicale, 2, rue du Docteur Raymond Marcland, 87025 Limoges, France
3 Centre pour la schistosomiase et la parasitologie, Texaco Omnisport, P. O. Box 7244, Yaoundé, Cameroun.
4 Laboratoire de parasitologie et d’écologie, Faculté des sciences, Université de Yaoundé I, Yaoundé, Cameroun *Correspondance à: ffnouboue@yahoo.fr

Résumé
Contexte: La méthode Kato-Katz est recommandée par l’Organisation mondiale de la santé pour le diagnostic de l’infection à Schistosoma mansoni. Cependant, le nombre d’oeufs est sujet à une variabilité. Le but de cette étude est de déterminer la prévalence de l’infection à S. mansoni chez les écoliers en utilisant deux techniques différentes et de recommander la technique à utiliser systématiquement pour le diagnostic de cette infection.
Méthodologie: Des enquêtes sur le terrain sur des échantillons de selles provenant de 299 écoliers camerounais ont été menées en 2016 pour comparer l’efficacité des techniques de Kato-Katz et au formol-éther dans le diagnostic des infections à S. mansoni.
Résultats: Des oeufs de schistosomes ont été détectés dans 37 échantillons (12,3%) avec la technique de Kato-Katz et 61 échantillons (20,4%) avec la technique au formol-éther. La différence entre la prévalence observée pour les deux techniques était significative chez les hommes et chez les 10-12 ans (p <0,5).
Conclusion: La technique au formol-éther était plus sensible que la méthode de Kato-Katz pour détecter les oeufs de S. mansoni dans les matières fécales. En dépit de son coût, la technique formol-éther peut être utilisée systématiquement en laboratoire pour des études épidémiologiques sur la schistosomiase intestinale.

Mots-clés: formol-éther, Kato-Katz, Schistosoma mansoni, écoliers

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Comparison of two diagnostic techniques to determine the prevalence of Schistosoma mansoni infections in Cameroonian school children

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Seroprevalence of microbial organisms during routine infertility evaluation at University of Benin Teaching Hospital, Benin-City, Nigeria

*Osaikhuwuomwan, J. A., and Sodje, J. D. K.

Department of Obstetrics and Gynaecology, College of Medical Sciences, University of Benin, Benin-City, Nigeria

*Correspondence to: jagbons1@yahoo.com & james.osaikhuwuomwan@uniben.edu

Abstract:
Background: The association of genital microorganism with infertility has been documented but no consensus exists. Understanding their prevalence amongst infertile clients may assist in facilitating better screening protocols. The objective of this study is to determine the prevalence of microorganisms routinely screened among women undergoing infertility evaluation at the University of Benin Teaching Hospital. Methods: A three year (January 2015 to December 2017) retrospective survey of all patients evaluated for infertility at the assisted reproduction unit of the hospital was undertaken. Chlamydia trachomatis, Ureaplasma urealyticum, Mycoplasma hominis, cytomegalovirus (CMV), hepatitis B (HBV), hepatitis C (HCV) virus and the human immunodeficiency virus (HIV) were microorganisms serologically assayed at the unit. We analyzed data containing patients’ demography and results of serological assay of these microorganisms. Results: There were 576 patients (288 couples) who completed their microbiological evaluation during the study period. The mean age (years) of female partners was 38.2±5.7, while the mean age of the male partners was 42.7±6.1. The frequency of CMV positive assay for infertile couples was 129 (22.4%); C. trachomatis 125 (21.7%); M. hominis 92 (15.9%) and U. urealyticum 76 (13.2%). Overall, more women (50.7%) were seropositive compared to men (26%). HIV was positive in 10 patients (1.73%) with 60% being women. HBV was seropositive in 8 (1.4%) (women 62.5% and men 37.5%) while HCV was positive in only 2 (0.3%) patient. Majority (over 80%) of couples were sero-discordant with 20% (2) concordance rate for HIV and 12.5% (1) for hepatitis B. Conclusion: Despite a relatively high seroprevalence rate of the studied microorganisms, the documented uncertainty on their association with infertility or its treatment limits justification for incorporation of routine screening of microbiological organisms into standard protocols for evaluation of infertile couples. A robust study on the impact of genital microorganism on specific infertility variables with comparison to fertile controls is recommended.

Keywords: microorganism, viruses, infertility, assisted reproduction, serological assay, screening

Received March 20, 2019; Revised May 7, 2019; Accepted May 9, 2019

Copyright 2019 AJCEM Open Access. This article is licensed and distributed under the terms of the Creative Commons Attrition 4.0 International License (http://creativecommmons.org/licenses/by/4.0), which permits unrestricted use, distribution and reproduction in any medium, provided credit is given to the original author(s) and the source.

 

Séroprévalence d’organismes microbiens au cours de l’évaluation de routine de l’infertilité à l’hôpital universitaire de Benin, Benin-City, Nigéria

*Osaikhuwuomwan, J. A., and Sodje, J. D. K.
Département d’obstétrique et de gynécologie, Collège des sciences médicales, Université du Bénin, Benin-City, Nigéria

*Correspondance à: jagbons1@yahoo.com & james.osaikhuwuomwan@uniben.edu

Abstrait:
Contexte: L’association d’un microorganisme génital à l’infertilité a été documentée mais il n’y a pas de consensus. Comprendre leur prévalence chez les clients infertiles peut aider à faciliter de meilleurs protocoles de dépistage. L’objectif de cette étude est de déterminer la prévalence des micro-organismes régulièrement dépistés chez les femmes subissant une évaluation de la stérilité à l’hôpital universitaire de Bénin. Méthodes: Une enquête rétrospective de trois ans (de janvier 2015 à décembre 2017) sur tous les patients évalués pour l’infertilité dans l’unité de procréation assistée de l’hôpital a été entreprise. Chlamydia trachomatis, Ureaplasma urealyticum, Mycoplasma hominis, cytomégalovirus (CMV), l’hépatite B (VHB), le virus de l’hépatite C (VHC) et le virus de l’immunodéficience humaine (VIH) étaient des microorganismes testés sérologiquement à l’unité. Nous avons analysé les données contenant la démographie des patients et les résultats du dosage sérologique de ces micro-organismes. Résultats: 576 patients (288 couples) ont terminé leur évaluation microbiologique au cours de la période d’étude. L’âge moyen (en années) des partenaires féminins était de 38,2 ± 5,7 ans, tandis que l’âge moyen des partenaires masculins était de 42,7 ± 6,1. La fréquence du test CMV-positif pour les couples infertiles était de 129 (22,4%); C. trachomatis 125 (21,7%); M. hominis 92 (15,9%) et U. urealyticum 76 (13,2%). Dans l’ensemble, plus de femmes (50,7%) étaient séropositives que d’hommes (26%). Le VIH était positif chez 10 patients (1,73%), dont 60% de femmes. Le VHB était séropositif chez 8 (1,4%) (les femmes 62,5% et les hommes 37,5%), tandis que le VHC était positif chez seulement 2 patients (0,3%). La majorité (plus de 80%) des couples étaient sérodiscordants avec un taux de concordance de 20% pour le VIH et de 12,5% (1) pour l’hépatite B. Conclusion: Malgré un taux de séroprévalence relativement élevé des microorganismes étudiés, l’incertitude documentée de leur l’association à l’infertilité ou à son traitement limite la justification de l’incorporation du dépistage systématique des organismes microbiologiques dans les protocoles standard d’évaluation des couples infertiles. Une étude robuste sur l’impact des microorganismes génitaux sur des variables spécifiques d’infertilité comparées aux témoins fertiles est

Mots-clés: microorganisme, virus, infertilité, procréation assistée, test sérologique, dépistage

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Seroprevalence of microbial organisms during routine infertility evaluation at University of Benin Teaching Hospital, Benin-City, Nigeria

 

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Characterization of antibiotic-resistant Staphylococcus aureus from gills and gastro-intestinal tracts of catfish (Clarias gariepinus), and water samples from Jabi Lake, Abuja, Nigeria

*Matouke, M. M., and Nour, K.

Department of Biological Sciences, Baze University, Abuja, Nigeria
*Correspondence to: matouke.moise@bazeuniversity.edu.ng

Abstract:
Background: The isolation of antibiotic resistant Staphylococcus aureus in freshwater fish poses a threat to public health because of the risk of human infections from consumption of such contaminated fish. Studies assessing antibiotic resistance of bacteria from body parts of fish and freshwater in Nigeria are sparse in the literature. This study therefore characterized S. aureus isolates from gills and gastrointestinal tract (GIT) of catfish (Clarias gariepinus), and water samples from Jabi Lake, Nigeria Methodology: Over a period of three months (April to June 2018), gills and GIT samples of 30 fish, and water samples randomly collected from 6 sites of the Lake, were cultured on Mannitol Salt Agar (MSA) for the isolation of S. aureus. Standard biochemical tests were used for bacteria identification, and antibiogram of the isolates was determined by the disc diffusion method
Results: The bacterial colony count in the gills (54.6±1.41 x 105 CFU/ml) and GIT (54.3±1.31 x 105 CFU/ml) was significantly higher (p<0.05) than the count from water sample (27.7±2.85 x 105 CFU/mL). S. aureus was isolated from 53% (16 of 30) of the gills, 57% (17 of 30) of the GIT, and 33% (2 of 6) of the water samples (p<0.05). Ninety four point one percent of S. aureus recovered from gills were resistant to ampicillin while 53.3% from the GIT were resistant to levofloxacin. S. aureus from water samples were resistant (100%) to ciprofloxacin, norfloxacin, gentamycin, amoxicillin, rifampicin, erythromycin, ampicillin and levofloxacin, and 50% were resistant to streptomycin and chloramphenicol
Conclusion: The presence of antibiotic resistant S. aureus in this study may be the result of selective antimicrobial pressure from anthropogenic activities as a result of abuse and overuse of antimicrobials leading to residual antibiotics in the aquatic environment

Keywords: Clarias gariepinus; gill, gastrointestinal tract; antibiotic; Staphylococcus

Received February 20, 2018; Revised April 26, 2019; Accepted April 29, 2019

Copyright 2019 AJCEM Open Access. This article is licensed and distributed under the terms of the Creative Commons Attrition 4.0 International License (http://creativecommmons.org/licenses/by/4.0), which permits unrestricted use, distribution and reproduction in any medium, provided credit is given to the original author(s) and the source.

 

Caractérisation de Staphylococcus aureus résistant aux antibiotiques à partir de branchies et du tractus gastro-intestinal de poisson-chat (Clarias gariepinus) et d’échantillons d’eau du lac Jabi, Abuja, Nigéria

* Matouke, M. M. et Nour, K.

Département des sciences biologiques, Université Baze, Abuja, Nigeria *Correspondance à: matouke.moise@bazeuniversity.edu.ng

Abstrait:

Contexte: L’isolement de Staphylococcus aureus résistant aux antibiotiques chez des poissons d’eau douce constitue une menace pour la santé publique en raison du risque d’infections humaines résultant de la consommation de ce poisson contaminé. Les études évaluant la résistance aux antibiotiques de bactéries provenant de parties du corps de poissons et d’eau douce au Nigéria sont rares dans la littérature. Cette étude a donc caractérisé les isolats de S. aureus provenant des branchies et du tractus gastro-intestinal de poisson-chat (Clarias gariepinus), ainsi que des échantillons d’eau de Jabi Lake, au Nigeria. Méthodologie: sur une période de trois mois (avril à juin 2018), échantillons de branchies et de GIT. de 30 poissons et d’échantillons d’eau prélevés au hasard sur 6 sites du lac ont été cultivés sur gélose au sel de mannitol (MSA) afin d’isoler S. aureus. Des tests biochimiques standard ont été utilisés pour l’identification des bactéries et l’antibiogramme des isolats a été déterminé par la méthode de diffusion sur disque.
Résultats: Le nombre de colonies bactériennes dans les branchies (54,6 ± 1,41 x 105 UFC/ml) et le GIT (54,3 ± 1,31 x 105 UFC/ml) étaient significativement plus élevés (p <0,05) que le nombre issu de l’échantillon d’eau (27,7 ± 2,85 105 UFC/mL). S. aureus a été isolé chez 53% (16 sur 30) des branchies, 57% (17 sur 30) du GIT et 33% (2 sur 6) des échantillons d’eau (p <0,05). Quatre-vingt-quatorze pour cent des S. aureus récupérés des branchies étaient résistants à l’ampicilline, tandis que 53,3% des GIT étaient résistants à la lévofloxacine. S. aureus à partir d’échantillons d’eau était résistant (100%) à la ciprofloxacine, la norfloxacine, la gentmycine, l’amoxicilline, la rifampicine, l’érythromycine, l’ampicilline et la lévofloxacine, et 50% étaient résistants à la streptomycine et au chloramphénicol
Conclusion: La présence de S. aureus résistant aux antibiotiques dans cette étude peut être le résultat d’une pression antimicrobienne sélective résultant d’activités anthropiques résultant d’un usage abusif et excessif d’antimicrobiens entraînant la présence d’antibiotiques résiduels dans le milieu aquatique.

Mots-clés: Clarias gariepinus; branchies, tractus gastro-intestinal; antibiotique; Staphylocoque

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Characterization of antibiotic-resistant Staphylococcus aureus from gills and gastro-intestinal tracts of catfish (Clarias gariepinus), and water samples from Jabi Lake, Abuja, Nigeria