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COVID-19 in children aged 0-15 years seen at Amirou Boubacar Diallo National Hospital in Niamey, Niger, 2020-2021

1,2Idé Amadou, H., 3Mahamadou Yacouba, M., 2,4Dodo, B., 5Boua Togola, O., 2,4Aboubacar, S., 6Ousmane, A., 2,4Garba, M., and 2Mainassara, S.

1Medical and Health Research Center (CERMES), BP: 10887, Niamey, Niger

2Amirou Boubacar Diallo National Hospital (HNABD), BP: 10146, Niamey, Niger

3Direction of Surveillance and Response to Epidemics (DSRE), BP: 623, Niamey, Niger

4Faculty of Health Sciences, Abdou Moumouni University of Niamey, BP: 10146, Niamey, Niger 5General Direction of Health and Public Hygiene, BP: 233, Bamako, Mali 6Faculty of Health Sciences, Dan Dicko Dan Koulodo University of Maradi, Niger *Correspondence to: ide.habibatou@yahoo.fr; Tel: 00 227 91 12 50 30/ 98 34 36 68

Abstract:
Background: In 2020, the COVID-19 pandemic affected all age groups. Although COVID-19 is generally benign in children, a diagnostic problem may arise due to clinical similarities with certain pathologies such as malaria, dengue fever and influenza. The objective of this study is to describe the epidemiological profile of COVID 19 in children seen at consultation and to determine the prevalence of influenza, malaria and dengue fever as differential diagnoses. Continue reading “COVID-19 in children aged 0-15 years seen at Amirou Boubacar Diallo National Hospital in Niamey, Niger, 2020-2021”

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Molecular detection of antimicrobial resistance genes in multidrug-resistant Gram-negative bacteria isolated from clinical samples in two hospitals in Niger

*1Abdoulaye, O., 2Abdoulaye, I., 3Alassane Halawen, M., 4Ibrahim Mamadou, A. K., 1,5Maman Sani Falissou, S., 5,6Adamou Amatagas, S., 1Boureima, H., 2Boubacar Issaka, B., 2Ide, H., 7Yacouba, A., 1,5Sidi Maman Bacha, B., 3Chaibou, S., 2Hamadou, I., 1Harouna Amadou, M. L., 2Ousmane, S., 5Doutchi, M., and 7Mamadou, S.

1Faculté des Sciences de la Santé, Université de Dan Dicko Dankoulodo de Maradi, BP 465, Niger

2Centre de Recherche Médicale et Sanitaire, Niamey, Niger

3Hôpital Général de Référence de Niamey, Niger

4Centre Hospitalier Régional de Dosso, Niger

5Hôpital National de Zinder, Niger

6Faculté des Sciences de la Santé, Université André Salifou de Zinder, Niger

7Faculté des Sciences de la Santé, Université Abdou Moumouni, Niamey, Niger

*Correspondence to: ousmaneabdoulaye2010@yahoo.com; Cel: (+227) 96354580

Abstract:
Background: According to the World Health Organization (WHO), bacterial resistance to antibiotics is a global public health challenge, which is also developing in Niger. The aim of this study was to determine the prevalence of antibiotic resistance genes in Gram-negative bacilli isolated from clinical samples in the biological laboratories of two selected health facilities in Niger. Continue reading “Molecular detection of antimicrobial resistance genes in multidrug-resistant Gram-negative bacteria isolated from clinical samples in two hospitals in Niger”

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Molecular characterization of extended spectrum beta-lactamase among clinical multidrug resistant Escherichia Coli in two hospitals of Niamey, Niger

A. M. Fody, T. S Bagré, A. K. Traoré, A Yacouba, R. Dembelé, L. Boubou, A. Inoussa, R. Sidikou, A. S. Traoré, A. Gassama-Sow, N. Barro

 

Abstract

Objective: The aim of this study was to identify the multiple ESBL genes in Multidrug-resistant (MDR) Escherichia coli isolated in various biological samples in two hospitals of Niamey.
Methodology: A total of 195 multidrug-resistant Escherichia coli were included in the study. These isolates were tested using polymerase chain reaction (PCR) for detection of the presence of bla CTX-M, bla TEM, bla SHV and bla OXA-1 beta-lactamase genes.
Results: A total of 27.7% of Escherichia coli isolates were ESBL producing strains. Globaly, the bla TEM gene was the most prevalent (70.3%) followed by bla CTX-M (43.1%), bla OXA-1 (31.8%) and bla SHV (4.1%) genes. The four genes type of ESBL were founded simultaneously only in stool samples. Furthermore, none bla SHV gene was found in other samples type.
Conclusion: This study showed the presence of various ESBL genes among clinical MDR Escherichia coli. That is why a rational use of antibiotic and appropriate methods of screening ESBL genes in routine laboratories in Niger is needed to control the ESBL genes dissemination.

Keywords: MDR ,Escherichia coli, ESBL, bla genes, PCR, Niamey, Niger.

 

Caracterisation moleculaire des betalactamases a spectre etendu chez les souches de Escherichia coli multi resistantes dans deux hopitaux de Niamey, au Niger

Objectifs: Le but de cette étude était d’identifier les multiples gènes de BLSE chez les souches de Escherichia coli multi résistantes isolées de différents types d’échantillons biologiques dans deux hôpitaux de Niamey.
Méthodologie : Un total de 195 Escherichia coli multi résistants a été inclus dans l’étude. Ces isolats ont été testés par la réaction de polymérase en chaîne (PCR) pour détecter la présence des gènes bla CTX-M, bla TEM, bla SHV et bla OXA-1.
Résultats : Au total, 27,7% des isolats de Escherichia coli multi-résistants étaient des souches productrices de BLSE. Globalement le gène blaTEM (70,3%) était le plus détecté suivi des autres gènes bla CTX-M (43,1%), bla OXA-1 (31,8%) et bla SHV (4,1%). Notons que seul dans les échantillons de selles quatre types de gènes de BLSE ont été trouvés simultanément. Par ailleurs notons qu’aucun gène de type bla SHV n’a été trouvé dans les autres types d’échantillons.
Conclusion : Cette étude avait montré la présence de divers gènes de BLSE chez les souches cliniques de Escherichia coli. C’est pourquoi une utilisation rationnelle des antibiotiques et des méthodes appropriées de dépistage des gènes de BLSE dans les laboratoires sont nécessaires afin de contrôler la diffusion des gènes de BLSE.

Mots clés : Escherichia coli multi résistantes, BLSE, gènes bla, PCR, Niamey, Niger

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Molecular characterization of extended spectrum beta-lactamase among clinical multidrug resistant Escherichia Coli in two hospitals of Niamey, Niger