Antibiogram of Pseudomonas species: an important tool to combat antibiotic resistance for patient safety in Gombe, Nigeria

   1Manga, M. M., *1Ibrahim, M., 2Isaac, E. W., 3Hassan, M. D., 3Muhammad, G.,  3Hassan, U. M., and 4Yunusa-Kaltungo, Z.

1Department of Medical Microbiology and Immunology, Gombe State University/ Federal Teaching Hospital, Gombe, Nigeria

2Infectious Diseases Unit, Department of Paediatrics, Gombe State University/  Federal Teaching Hospital, Gombe, Nigeria

3Department of Medical Microbiology and Immunology, Federal Teaching Hospital, Gombe, Nigeria

4Plastic Surgery Unit, Department of Surgery, Federal Teaching Hospital, Gombe, Nigeria

*Correspondence to: mohgembu@yahoo.com; +2348060232264

Abstract:

Background: Pseudomonas species are responsible for different healthcare-associated infections and are inherently resistant to many commonly used antibiotics. Hospital antibiograms are either absent or not regularly available in most healthcare facilities in Nigeria. The objective of this study is to present the antibiogram of Pseudomonas isolates in Federal Teaching Hospital Gombe (FTHG) in order to guide antibiotic prescription for better patient safety in the hospital.   

Methodology: The is a hospital-based cross-sectional study. A total of 4309 bacterial isolates were recovered from aerobic cultures of routine clinical specimens including urine, sputum, blood, swabs, aspirates, biopsies, seminal fluids and cerebrospinal fluids at the Medical Microbiology laboratory of the hospital between January and December 2019. Pseudomonas species were identified by colony morphology, Gram-reaction and conventional biochemical tests. Antibiotic susceptibility testing was performed on each Pseudomonas isolate using the modified Kirby-Bauer disk diffusion method on Mueller-Hinton agar and results interpreted according to the guideline of the Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Data were analysed using the Statistical Package for Social Sciences (SPSSTM) software version 23.0.

Results: Of the total 4309 bacterial isolates, 436 (10.1%) Pseudomonas species were identified, with majority (49.8%) from urine specimens. Antibiotic susceptibility test results revealed average susceptibility rates of 73.8%, 70.1%, 66.2%, 59.5%, and 34.3% to ciprofloxacin, gentamicin, levofloxacin ceftazidime, and carbenicillin respectively. These rates fluctuate only slightly for each of the antibiotic during the 12 months period of survey.

Conclusion: Pseudomonas species were most sensitive to ciprofloxacin and gentamicin among the first line antibiotics in FTHG in 2019. Regular updates and presentation of hospital antibiogram especially for intrinsically resistant bacteria such as Pseudomonas involved in healthcare associated infections, is an important tool in combating antimicrobial resistance and ensuring patient safety.

Keywords: antibiogram, Pseudomonas, antimicrobial resistance, antimicrobial stewardship, patient safety

Received Jan 10, 2021; Revised Mar 7, 2021; Accepted Mar 8, 2021

Copyright 2021 AJCEM Open Access. This article is licensed and distributed under the terms of the Creative Commons Attrition 4.0 International License <a rel=”license” href=”//creativecommons.org/licenses/by/4.0/, which permits unrestricted use, distribution and reproduction in any medium, provided credit is given to the original author(s) and the source. Editor-in-Chief: Prof. S. S. Taiwo

 

Antibiogramme des espèces de Pseudomonas: un outil important pour lutter contre la résistance aux antibiotiques pour la sécurité des patients à Gombe, Nigéria

1Manga, M. M., *1Ibrahim, M., 2Isaac, E. W., 3Hassan, M. D., 3Muhammad, G.,  3Hassan, U. M., et 4Yunusa-Kaltungo, Z.

2Unité des maladies infectieuses, Département de pédiatrie, Université d’État de Gombe/ Hôpital d’enseignement fédéral, Gombe, Nigéria

3Département de microbiologie médicale et d’immunologie, Hôpital d’enseignement fédéral, Gombe, Nigéria

4Unité de chirurgie plastique, Département de chirurgie, Hôpital universitaire fédéral, Gombe, Nigéria

*Correspondance à: mohgembu@yahoo.com; +2348060232264

Abstrait:

Contexte: Les espèces de Pseudomonas sont responsables de différentes infections associées aux soins de santé et sont intrinsèquement résistantes à de nombreux antibiotiques couramment utilisés. Les antibiogrammes hospitaliers sont absents ou ne sont pas régulièrement disponibles dans la plupart des établissements de santé au Nigéria. L’objectif de cette étude est de présenter l’antibiogramme des isolats de Pseudomonas dans l’Hôpital Universitaire Fédéral de Gombe (FTHG) afin d’orienter la prescription d’antibiotiques pour une meilleure sécurité des patients à l’hôpital.

Méthodologie: Il s’agit d’une étude transversale en milieu hospitalier. Un total de 4309 isolats bactériens ont été récupérés à partir de cultures aérobies d’échantillons cliniques de routine, y compris l’urine, les crachats, le sang, les prélèvements, les aspirations, les biopsies, les fluides séminal et les fluides céphalo-rachidiens au laboratoire de microbiologie médicale de l’hôpital entre janvier et décembre 2019. Les espèces de Pseudomonas étaient identifié par la morphologie de la colonie, la réaction Gram et les tests biochimiques conventionnels. Des tests de sensibilité aux antibiotiques ont été réalisés sur chaque isolat de Pseudomonas en utilisant la méthode de diffusion sur disque Kirby-Bauer modifiée sur gélose Mueller-Hinton et les résultats ont été interprétés selon les directives du Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Les données ont été analysées à l’aide du logiciel Statistical Package for Social Sciences (SPSSTM) version 23.0.

Résultats: Sur les 4309 isolats bactériens au total, 436 (10,1%) espèces de Pseudomonas ont été identifiées, la majorité (49,8%) à partir d’échantillons d’urine. Les résultats des tests de sensibilité aux antibiotiques ont révélé des taux moyens de sensibilité respectivement de 73,8%, 70,1%, 66,2%, 59,5% et 34,3% à la ciprofloxacine, à la gentamicine, à la lévofloxacine ceftazidime et à la carbénicilline. Ces taux ne fluctuent que légèrement pour chacun des antibiotiques au cours de la période de 12 mois d’enquête.

Conclusion: les espèces de Pseudomonas étaient les plus sensibles à la ciprofloxacine et à la gentamicine parmi les antibiotiques de première intention dans le FTHG en 2019. Les mises à jour régulières et la présentation de l’antibiogramme hospitalier, en particulier pour les bactéries intrinsèquement résistantes telles que les Pseudomonas impliquées dans les infections associées aux soins, sont un outil important dans la lutte contre la résistance aux antimicrobiens et assurer la sécurité des patients.

Mots clés: antibiogramme, Pseudomonas, résistance aux antimicrobiens, gestion des antimicrobiens, sécurité des patients

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Antibiogram of Pseudomonas species: an important tool to combat antibiotic resistance for patient safety in Gombe, Nigeria