*Abayomi, S. A., Adegboro, B., and Taiwo, S. S.
Department of Medical Microbiology and Parasitology, Ladoke Akintola University of Technology (LAUTECH) Teaching Hospital, PMB 4007, Ogbomoso, Nigeria *Correspondence to: subslaabayomi@gmail.com
Abstract:
Background: The extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) producing enterobacteriaceae are a major public health threat globally, causing both community and healthcare associated infections (HAIs). Due to multi-resistant nature of these strains, infections caused by them are associated with treatment failure, high mortality, and increased healthcare costs. This laboratory survey determined the prevalence of infections caused by ESBL-producing enterobacteriaceae in LAUTECH Teaching Hospital, Ogbomoso Methodology: Over three years (January 2016 to December 2018), non-duplicate clinical samples (sputum, blood, urine, and wound swabs) collected from hospitalised patients with suspected clinical infections were routinely processed at microbiology laboratory of our hospital for aerobic culture and isolation of enterobacteriaceae. Antibiotic susceptibility of each isolate to routinely used antibiotics was determined by the disk diffusion method and ‘double disk’ synergy test was used to routinely confirm ESBL production. Demographic and clinical data were extracted from the requisition form. Results: Of the total 4,198 hospitalised patients over the three year period, 1,222 (29.1%) had clinical infections, out of which 689 (16.4%) were laboratory confirmed. Enterobacteriaceae were isolated from 343 patients (prevalence rate, 8.2%) while ESBL producers were isolated from 46 (prevalence rate, 1.1%). The most frequent enterobacteriaceae were Klebsiella spp (54.5%) and Escherichia coli (35.9%) recovered mainly from urinary tract infection (UTI, 45.2%), skin and soft tissue infection (SSTI, 27.9%) and lower respiratory tract infection (LRTI, 17.5%) but ESBL producers were frequently associated with osteomyelitis (50%), LRTI (18.3%) and SSTI (14.6%). The ESBL producers were all resistant to ampicillin, cefotaxime, ceftazidime, cefepime, gentamicin, and ciprofloxacin but susceptible to imipenem. The non-ESBL producers were comparatively less resistant with 43.8%, 34.3%, 29%, 35%, 43%, 37%, and 4% resistant to ampicillin, cefotaxime, ceftazidime, cefepime, gentamicin, ciprofloxacin and imipenem respectively. Conclusion: The prevalence of clinical infections among hospitalised patients in our facility is high but the rate of ESBL-producing enterobacteriaceae is relatively low. In spite of this, there is need for continuous surveillance of ESBL and other antibiotic resistant pathogens as part of the infection prevention and control (IPC) programme, with implementation of measures that will reduce the incidence of these infections in our hospital.
Keywords: Laboratory survey, hospitalised patients, ESBL, multidrug resistance
Received Sept 4, 2019; Revised September 20, 2019; Accepted September 21, 2019
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Enquête de laboratoire sur les entérobactéries productrices de bêta-lactamases à spectre étendu lors d’infections cliniques chez des patients hospitalisés à l’hôpital universitaire LAUTECH, à Ogbomoso, au Nigéria
*Abayomi, S. A., Adegboro, B., et Taiwo, S. S.
Laboratory survey of ESBL-producing enterobacteriaceae Afr. J. Clin. Exper. Microbiol. 2020; 21(1): 66-71
Département de microbiologie médicale et de parasitologie, Hôpital universitaire de l’Université technique de Ladoke Akintola (LAUTECH), PMB 4007, Ogbomoso, Nigéria *Correspondance à: subslaabayomi@gmail.com
Abstrait:
Contexte: Les entérobactéries productrices de bêta-lactamase à spectre étendu (BLSE) constituent une menace majeure pour la santé publique dans le monde, provoquant à la fois des infections dans la communauté et des infections associées aux soins de santé. En raison de la nature multirésistante de ces souches, les infections qu’elles provoquent sont associées à un échec du traitement, à une mortalité élevée et à une augmentation des coûts de soins de santé. Cette enquête en laboratoire a permis de déterminer la prévalence d’infections causées par des entérobactéries productrices de BLSE à l’hôpital universitaire LAUTECH, à Ogbomoso. Méthodologie: Sur trois ans (janvier 2016 à décembre 2018), des échantillons cliniques non dupliqués (expectorations, sang, urine, et plaies oreilles) prélevés chez des patients hospitalisés présentant des suspicions d’infections cliniques ont été systématiquement traités dans le laboratoire de microbiologie de notre hôpital pour culture aérobie et isolement d’entérobactériacées. La sensibilité aux antibiotiques de chaque isolat aux antibiotiques utilisés en routine a été déterminée par la méthode de diffusion sur disque et un test de synergie «double disque» a été utilisé pour confirmer en routine la production de BLSE. Les données démographiques et cliniques ont été extraites du formulaire de demande. Résultats: Sur un total de 4198 patients hospitalisés au cours de la période de trois ans, 1222 (29,1%) ont présenté une infection clinique, dont 689 (16,4%) ont été confirmés en laboratoire. Des entérobactéries ont été isolées chez 343 patients (taux de prévalence de 8,2%), tandis que les producteurs de BLSE ont été isolés chez 46 patients (taux de prévalence de 1,1%). Les entérobactériacées les plus fréquentes étaient Klebsiella spp (54,5%) et Escherichia coli (35,9%) principalement dues à une infection des voies urinaires (UTI, 45,2%), une infection de la peau et des tissus mous (SSTI, 27,9%) et des voies respiratoires inférieures (LRTI, 17,5%), mais les producteurs de BLSE étaient fréquemment associés à l’ostéomyélite (50%), au LRTI (18,3%) et au SSTI (14,6%). Les producteurs de BLSE étaient tous résistants à l’ampicilline, au céfotaxime, à la ceftazidime, au céfépime, à la gentamicine et à la ciprofloxacine, mais sensibles à l’imipénem. Les producteurs non BLSE étaient comparativement moins résistants, avec respectivement 43,8%, 34,3%, 29%, 35%, 43%, 37% et 4% de résistance à l’ampicilline, au céfotaxime, au ceftazidime, au céfépime, à la gentamicine, à la ciprofloxacine et à l’imipénème. Conclusion: La prévalence d’infections cliniques chez les patients hospitalisés dans notre établissement est élevée mais le taux d’entérobactéries productrices de BLSE est relativement faible. Malgré cela, il est nécessaire de surveiller en permanence les BLSE et les autres agents pathogènes résistants aux antibiotiques dans le cadre du programme de prévention et de contrôle des infections (IPC), avec la mise en oeuvre de mesures permettant de réduire l’incidence de ces infections dans notre hôpital.
Mots clés: Enquête de laboratoire, patients hospitalisés, BLSE, résistance, multiple aux médicaments
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