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Molecular characterization of extended spectrum beta-lactamase among clinical multidrug resistant Escherichia Coli in two hospitals of Niamey, Niger

A. M. Fody, T. S Bagré, A. K. Traoré, A Yacouba, R. Dembelé, L. Boubou, A. Inoussa, R. Sidikou, A. S. Traoré, A. Gassama-Sow, N. Barro

 

Abstract

Objective: The aim of this study was to identify the multiple ESBL genes in Multidrug-resistant (MDR) Escherichia coli isolated in various biological samples in two hospitals of Niamey.
Methodology: A total of 195 multidrug-resistant Escherichia coli were included in the study. These isolates were tested using polymerase chain reaction (PCR) for detection of the presence of bla CTX-M, bla TEM, bla SHV and bla OXA-1 beta-lactamase genes.
Results: A total of 27.7% of Escherichia coli isolates were ESBL producing strains. Globaly, the bla TEM gene was the most prevalent (70.3%) followed by bla CTX-M (43.1%), bla OXA-1 (31.8%) and bla SHV (4.1%) genes. The four genes type of ESBL were founded simultaneously only in stool samples. Furthermore, none bla SHV gene was found in other samples type.
Conclusion: This study showed the presence of various ESBL genes among clinical MDR Escherichia coli. That is why a rational use of antibiotic and appropriate methods of screening ESBL genes in routine laboratories in Niger is needed to control the ESBL genes dissemination.

Keywords: MDR ,Escherichia coli, ESBL, bla genes, PCR, Niamey, Niger.

 

Caracterisation moleculaire des betalactamases a spectre etendu chez les souches de Escherichia coli multi resistantes dans deux hopitaux de Niamey, au Niger

Objectifs: Le but de cette étude était d’identifier les multiples gènes de BLSE chez les souches de Escherichia coli multi résistantes isolées de différents types d’échantillons biologiques dans deux hôpitaux de Niamey.
Méthodologie : Un total de 195 Escherichia coli multi résistants a été inclus dans l’étude. Ces isolats ont été testés par la réaction de polymérase en chaîne (PCR) pour détecter la présence des gènes bla CTX-M, bla TEM, bla SHV et bla OXA-1.
Résultats : Au total, 27,7% des isolats de Escherichia coli multi-résistants étaient des souches productrices de BLSE. Globalement le gène blaTEM (70,3%) était le plus détecté suivi des autres gènes bla CTX-M (43,1%), bla OXA-1 (31,8%) et bla SHV (4,1%). Notons que seul dans les échantillons de selles quatre types de gènes de BLSE ont été trouvés simultanément. Par ailleurs notons qu’aucun gène de type bla SHV n’a été trouvé dans les autres types d’échantillons.
Conclusion : Cette étude avait montré la présence de divers gènes de BLSE chez les souches cliniques de Escherichia coli. C’est pourquoi une utilisation rationnelle des antibiotiques et des méthodes appropriées de dépistage des gènes de BLSE dans les laboratoires sont nécessaires afin de contrôler la diffusion des gènes de BLSE.

Mots clés : Escherichia coli multi résistantes, BLSE, gènes bla, PCR, Niamey, Niger

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Molecular characterization of extended spectrum beta-lactamase among clinical multidrug resistant Escherichia Coli in two hospitals of Niamey, Niger

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In vitro antimicrobial activity of fermented spices and Capsicum Frutescens against multi drug resistance clinical isolate and standard reference bacteria

G. Ameya, A. Aklilu, N. Bisrat, M. Nassir, A Negash

 

Abstract

Introduction: Food preservation is required to maintain for a long period of time. Traditional organic food preservative, “Datta” is spice mainly made up of Chili Peppers which frequently used in southern and western part of Ethiopia. Datta can be consumed almost with every kind of foods and it is believed as appetizer and antimicrobial agent against food borne pathogen. This study aimed to assess in vitro antimicrobial activity of fermented condiment and Capsicum frutescens against multi drug resistance clinical isolate and standard reference bacteria.
Method: Datta samples collected from different level hotels and Capsicum frutescens (Chili peppers) were extractedin different solvents.Agar well diffusion assay was used to determine antimicrobial activity and minimum inhibitory concentration (MIC) and minimum bactericidal concentration was determined by tube dilution method. One way analysis of variant was used in comparison of the finding.
Results: Extracted fermented condiment (Datta) sample and Chili Pepper showed antimicrobial activities against multidrug resistant clinical isolate and standard reference bacteria in well diffusion assay. Datta extract showed MIC ranged from 25 mg/L to 66.7 mg/L and MBC ranged from 25 mg/L to 100 mg/L. The Datta and Chili pepper extracts showed high antimicrobial activities against standard Staphylococcus aureus. The water based extract of Datta sample were exhibited significantly low antimicrobial activities (P=0.000) as compared to the other extraction solvents.
Conclusion: Water was weak extractor of active compounds having antimicrobial activities. Reference S. aureuswasmore susceptible organism while ATCC Salmonella enteritidis and clinical isolated multi-drug resistant E. coli less susceptible. The traditional use of fermented condiment for food preservation by the local people is supported by this study.

Key words: Antimicrobial activity, Chili Pepper extract, Fermented condiment, Minimum bactericidal concentration, Minimum inhibition contraction

Activite antimicrobienne en vitro d’epices fermentees et de fruits de capsicume pour la resistance aux medicaments isolate clinique et bacteries de reference standard

Introduction: La conservation des aliments est nécessaire pour maintenir pendant une longue période de temps. Conservateur de nourriture organiqu et raditionnel, “Datta” est l’épicé compose principalement de Chili Peppers qui fréquemment utilize dans le sud et l’ouest de l’Ethiopie. Datta peu têtre consommé presque avec toutes sortes d’aliments et on le croit comme un apéritif et un agent antimicrobien contre l’agent pathogène alimentaire. Cette etude visait à évaluer l’activité antimicrobienne in vitro du condiment fermenté et Capsicum frutescens contre l’isolement clinique de résistance aux médicaments multiples et les bactéries de référence standard.
Méthode: Les échantillons de Datta prélevés dans des hôtels de différents niveaux et Capsicum frutescens (Chili Peppers) ont été extraits dans différents solvants. Un dosage de diffusion de puits a été utilisé pour determiner l’activité antimicrobienne et la concentration inhibitrice minimale (MIC) et la concentration bactericide minimale a été determine par la méthode de dilution du tube. Une analyse à sens unique de la variante a été utilisée en comparaison de la découverte.
Résultats: L’échantillon extrait de condiments fermentés (Datta) et Chili Pepper ont montré des activités antimicrobiennes contre l’isolement Clinique résistant aux médicaments multiples et les bactéries de référence standard dans le dosage par diffusion de puits. L’extrait de Datta a montréque le MIC variait de 25 mg / L à 66,7 mg / L et le MBC variait de 25 mg / L à 100 mg / L. Les extraits de poisson de Datta et de Chili ont montré des activités antimicrobiennes élevées contre Staphylococcus aureus standard. L’extrait à base d’eau de l’échantillon de Datta a montré des activités antimicrobiennes significativement faibles (P = 0,000) par rapport aux autres solvants d’extraction.
Conclusion: L’eauétaitun extracteur faible de composes actifs ayant des activités antimicrobiennes. Référence S. aureus était un organisme plus susceptible tandisque ATCC Salmonella enteritidis et E.coli. E. coli résistant aux médicaments multiples isolés était moins susceptible. L’utilisation traditionnelle du condiment fermenté pour la conservation des aliments par les populations locales est soutenue par cette étude.

Mots clés: Activitéantimicrobienne, Extrait de poivre de piment, Condiment fermenté, Concentration bactéricide minimum, Contraction minimaled’inhibition

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In vitro antimicrobial activity of fermented spices and Capsicum Frutescens against multi drug resistance clinical isolate and standard reference bacteria

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Bacterial contamination of white coats and hands of healthcare workers at mansoura university children’s hospital, Mansoura-Egypt

N. S Gouda, A. M. Sultan, H. Eldegla, W.A Seliem

 

Abstract

Background: Transmission of hospital acquired infections (HAIs) may be associated with contamination of healthcare workers’ (HCWs) hands and white coats.
Objective: The purpose of this study was to clarify the role of HCWs’ white coats in transmitting HAIs and to determine the association between bacterial contamination of HCWs’ hands and white coats.
Methods: A total of 154 HCWs were enrolled in the study; different samples were taken from their hands and white coats. Samples were processed and both microbiological and biochemical characterization of the isolates were done using standard microbiological protocols.
Results: Up to 65.6% of hands and 61% of coats of HCWs were contaminated by microorganisms. Staphylococcus aureus was the most commonly isolated organisms from both hands and coats of HCWs (29.2%, 27.3% respectively) followed by MRSA (22.1%, 24.7% respectively).
Conclusions: The risk for contamination of hands and coats of HCWs is high in different clinical settings. In order to reduce the rate of HAIs, a strict dress protocol should be set into play to prevent cross contamination between HCWs and patients.

Keywords: contamination, HCWs, coat, hand, Staphylococcus aureus, MRSA.

 

Contamination bacterienne de manteaux blancs et de mains de soins de sante a l’hopital pour enfants de l’universite mansoura, Mansoura-Egypte

Contexte: La transmission des infections

Objectif: Le but de cette étude était de déterminer l’étendue, le type et l’association entre la contamination bactérienne des mains des travailleurs de la santé et les blouses blanches.

Méthodes: Au total, 154 travailleurs de la santé ont été inclus dans l’étude; différents échantillons ont été pris de leurs mains et des manteaux blancs. Les échantillons ont été traités et la caractérisation microbiologique et biochimique des isolats a été effectuée en utilisant des protocoles microbiologiques standard.

Résultats: Jusqu’à 65,6% des mains et 61% des couches de TS ont été contaminées par des micro-organismes. Le Staphylococcus aureusétait le plus souvent isolé des deux mains et des deux sexes (29,2%, 27,3%), suivi par le SARM (22,1%, 24,7% respectivement).

Conclusions: Le risque de contamination des mains et des couches de TS est élevé dans différents contextes cliniques. Afin de réduire le taux d’IASS, un protocole vestimentaire strict devrait être mis en place pour prévenir la contamination croisée entre les travailleurs de la santé et les patients.

Mots clés: contamination, agents de santé, manteau, main, Staphylococcus aureus, SARM

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Bacterial contamination of white coats and hands of healthcare workers at mansoura university children’s hospital, Mansoura-Egypt

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Evaluating the use of dedicated swab for rapid antigen detection testing in group a streptococcal pharyngitis in children

A.M. Sultan, W.A Seliem

 

Abstract

Background: Group A streptococcus (GAS) is the most common and fearful bacterial cause in pediatric acute pharyngitis due to its serious complications. Several generations of rapid antigen detection tests (RADTs) have been developed to facilitate rapid detection of GAS pharyngitis. We assessed the value of using a dedicated swab for RADT rather than using the same swab for throat culture and RADT.
Methods: We conducted a prospective, single-center study that included children with suspected GAS pharyngitis. Paired throat swabs were taken simultaneously from each child. We dedicated one swab for RADT (RADT#1) and used the other swab to inoculate blood agar plate surface, and then immediately to process the RADT (RADT#2).
Results: The prevalence of GAS pharyngitis among the participants was 28% based on throat culture positive results. The RADT#1 and RADT#2 had sensitivity results of 92.9% and 84.3% respectively. Both RADT#1 and RADT#2 had 96.1% specificity.
Conclusion: We found that RADT resulted in a better sensitivity when one swab was dedicated for the test. Therefore, physicians are encouraged to use separate swabs for each diagnostic test when both RADT and throat culture are performed.

Key words: GAS, pharyngitis, rapid antigen detection test

 

Evaluation de l’utilisation d’un swab dedice pour des essais rapides de detection d’antigene dans le groupe a pharyngite streptococale en enfants

Contexte: Le streptocoque du groupe A (GAS) est la cause bactérienne la plus fréquente et la plus effrayante de la pharyngite aiguë pédiatrique due à ses graves complications. Plusieurs générations de tests de détection d’antigène rapide (RADT) ont été développés pour faciliter la détection rapide de la pharyngite GAS. Nous avons évalué la valeur de l’utilisation d’un tampon dédié pour RADT plutôt que d’utiliser le même écouvillon pour la culture de la gorge et la RAD

Méthodes: Nous avons mené une étude prospective et à centre unique comprenant des enfants atteints de pharyngite soupçonnée de GAS. Des écouvillons de gorge appariés ont été pris simultanément par chaque enfant. Nous avons dédié un écouvillon pour RADT (RADT # 1) et utilisé l’autre écouvillon pour inoculer la surface de la plaque d’agar de sang, puis immédiatement pour traiter le RADT (RADT # 2).

Résultats: La prévalence de la pharyngite GAS chez les participants était de 28% selon les résultats positifs de la culture de la gorge. Le RADT # 1 et le RADT # 2 ont des résultats de sensibilité de 92,9% et 84,3% respectivement. Les deux RADT # 1 et RADT # 2 avaient une spécificité de 96,1%.

Conclusion: Nous avons constaté que RADT a permis une meilleure sensibilité lorsqu’un tampon a été dédié au test. Par conséquent, les médecins sont encouragés à utiliser des écouvillons séparés pour chaque test de diagnostic lorsque la RADT et la culture de la gorge sont effectuées.

Mots clés: GAS, pharyngite, test rapide de détection d’antigène

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Evaluating the use of dedicated swab for rapid antigen detection testing in group a streptococcal pharyngitis in children

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Antifungal susceptibility and test for cure of candida species among vulvovaginal candidiasis patients in a secondary care hospital, Nigeria

C. E Ejike, N. R Agbakoba, C. C Ezeanya, F. E Emele, C. B Oguejiofor, J. Dirisu

 

Abstract

Background: Antimicrobial resistance among Candida species is an intense public health concern. The aim of the study was to determine the antifungal susceptibility pattern and test for cure of Candida species among women of child bearing age who visited the General Hospital Onitsha, Nigeria with symptoms suggestive of Vulvovaginal Candidiasis (VVC).
Materials and Methods: Eight hundred and seventy six female patients participated in the study of which high vaginal swabs were collected and evaluated mycological by standard microbiological methods: microscopic examination and culture using sabouraud dextrose agar (SDA). Susceptibility of isolates to 4 antifungal agents was tested using agar dilution method. Clinicomycological evaluation was also performed among the patients.
Result: Higher minimum inhibitory concentration (MIC) to azole antifungals was observed predominantly among non-albicans Candida speciesincreasingly involved in VVC. The rate of mycological resolution was higher than symptomatic relief at 2 weeks after treatment with antifungal drug.
Conclusion: Efficacious treatment of VVC requires an adequate knowledge of the causative agents and more importantly the antimicrobial to which they exhibit high susceptibility.

Keywords: Vulvovaginal Candidiasis, Clinico- mycology, Antimicrobial resistance, Candida species

Susceptibilite antifonique et test pour la cure d’especes de candida entre les patients de candidases vulvovaginales dans un hopital de soins secondaires, Nigeria

Contexte: La résistance aux antimicrobiens chez les espèces de Candida est un problème de santé publique intense. L’objectif de l’étude était de déterminer le schéma de susceptibilité aux antifongiques et le test de guérison des espèces de Candida parmi les femmes en âge de procréer qui ont visité l’hôpital général de Onitsha, au Nigeria, avec des symptômes suggérant une candidose vulvovaginale (VVC).

Matériaux et méthodes: huit cent soixante-seize six patientes ont participé à l’étude des prélèvements vaginaux élevés collectés et évalués par mycologie par méthodes microbiologiques standard: examen microscopique et culture à l’aide de la gélose sabouraud dextrose (SDA). La susceptibilité des isolats à 4 agents antifongiques a été testée en utilisant une méthode de dilution en agar. Une évaluation clinico-mycologique a également été réalisée chez les patients.

Résultat: une concentration minimale minimale d’inhibition (MIC) en anatoxines azoliques a été observée principalement chez les espèces non-albicans Candida de plus en plus impliquées dans VVC. Le taux de résolution mycologique était plus élevé que le soulagement symptomatique à 2 semaines après le traitement par un médicament antifongique.

Conclusion: Un traitement efficace de la VVC nécessite une connaissance adéquate des agents causaux et, plus important encore, des antimicrobiens auxquels ils présentent une forte susceptibilité.

Mots-clés: Candidiase Vulvovaginale, Clinico-mycologie, Résistance Antimicrobienne, Espèces Candida

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Antifungal susceptibility and test for cure of candida species among vulvovaginal candidiasis patients in a secondary care hospital, Nigeria

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Vulvo-vaginal candidosis in a cohort of hormonal contraceptive users in Ibadan, Nigeria

S.A. Fayemiwo, O.B Makanjuola, A. A. Fatiregun

 

Abstract

Introduction: Most women who acquire HIV and other sexually transmitted infections (STIs) are in their child bearing years and are current or potential users of contraceptive methods. The study was undertaken to provide information on the association between the hormonal contraceptive methods and vulvo vaginal candidiasis among women attending Family Planning clinics, University College Hospital, Ibadan, Nigeria.
Methods: It was a cross-sectional study in a population of women using hormonal contraceptive methods attending Family Planning clinics. Detailed medical history, endocervical and high vaginal swabs were collected from the women to establish diagnosis after clinical examination and informed consent. Aliquots of sera from venous blood samples of the women were tested for antibodies to HIV-1/2. Data was analysed using SPSS for windows’ version 17.0.
Results: There were 116 women using hormonal contraceptive methods who participated in the study with mean age of 28.70 years (SD = 6.72, range = 19 –54). The mean age of sexual debut of the women was 19.2 years (SD = 2.96). The prevalence of vulvo-vaginal candidosis was 23.3%. Other associated sexually transmitted infections were bacterial vaginosis (24.1%), HIV (12.1%), trichomoniasis (10.3%), chlamydia cervicitis (7.8%), syphilis (5.2%), genital warts (6.0%) and gonorrhoea (2.6%).Younger age of sexual debut influenced the decision of selecting various forms of hormonal contraceptives especially the emergence of oral contraceptive forms (P = 0.043). Majority of the women on hormonal contraceptives had multiple sexual partners. Vulvovaginal candidosis is strongly associated with vaginal discharge and pruritus in women utilizing hormonal contraceptive methods (P = 0.001, 4.2 (1.0–13.2).
Conclusions: Women seeking contraception to prevent unintended pregnancy are as much in need of education about prevention of STIs. The study found that younger age, numbers sexual partners, and use of hormonal contraceptives could increase the risk of acquiring vulvovaginal candidosis.

 

Candidose vulvo-vaginale dans une cohorte d’utilisateurs contraceptifs hormonaux a Ibadan, Nigeria

Introduction: La plupart des femmes qui contractent le VIH et d’autres infections sexuellement transmissibles (IST) sont en âge de procréer et sont des utilisatrices actuelles ou potentielles de méthodes contraceptives. L’étude a été entreprise pour fournir des informations sur l’association entre les méthodes contraceptives hormonales et la candidose vulvo vagin chez les femmes fréquentant les cliniques de planification familiale, University College Hospital, Ibadan, Nigeria.
Méthodes: Il s’agissait d’une étude transversale menée auprès d’une population de femmes utilisant des méthodes contraceptives hormonales dans des cliniques de planification familiale. Des antécédents médicaux détaillés, des prélèvements endocervicaux et des prélèvements vaginaux élevés ont été effectués auprès des femmes pour établir un diagnostic après un examen clinique et un consentement éclairé. Des aliquotes de sérums d’échantillons de sang veineux des femmes ont été testées pour rechercher des anticorps anti-VIH-1/2. Les données ont été analysées à l’aide de SPSS pour la version 17.0 des veuves.
Résultats: 116 femmes utilisant des méthodes contraceptives hormonales ont participé à l’étude avec un âge moyen de 28,70 ans (ET = 6,72, intervalle = 19-54). L’âge moyen des débuts sexuels des femmes était de 19,2 ans (ET = 2,96). La prévalence de la candidose vulvo-vaginale était de 23,3%. Les autres infections sexuellement transmissibles étaient la vaginose bactérienne (24,1%), le VIH (12,1%), la trichomonase (10,3%), la chlamydia cervicite (7,8%), la syphilis (5,2%), les verrues génitales et la gonorrhée. . L’âge plus jeune des débuts sexuels a influencé la décision de choisir différentes formes de contraceptifs hormonaux, en particulier l’émergence de formes contraceptives orales (p = 0,043). La majorité des femmes sur les contraceptifs hormonaux avaient plusieurs partenaires sexuels. La candidose vulvovaginale est fortement associée aux pertes vaginales et au prurit chez les femmes utilisant des méthodes contraceptives hormonales (p = 0,001, 4,2 (1,0-13,2).
Conclusions: Les femmes qui recherchent une contraception pour prévenir les grossesses non désirées ont autant besoin d’éducation sur la prévention des IST. L’étude a révélé que le plus jeune âge, le nombre de partenaires sexuels et l’utilisation de contraceptifs hormonaux pourraient augmenter le risque d’acquisition de la candidose vulvo-vaginale.

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Vulvo-vaginal candidosis in a cohort of hormonal contraceptive users in Ibadan, Nigeria

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Screening and partial purification of amylase from Aspergillus Niger isolated from deteriorated tomato (Lycopersicon Esculentum mill.) fruits

Y. D. Obafemi, A. A Ajayi, G. I. Olasehinde, O. M Atolagbe, E. A. Onibokun

 

Abstract

Amylases (EC 3.2.1.1) are cellwall degrading enzymes associated with the pathogenicity of microorganisms in the spoilage of tomato fruits. The use of amylase in many industries has made it very important to optimize production process to achieve maximum yields. Screening and partial purification of Amylase from Aspergillus niger isolated from tomato (Lycopersicon esculentum Mill.) fruits was studied. Amylase producing fungi were isolated from fresh tomatoes kept at ambient temperature (28±1˚C). Isolates were characterized on the basis of their morphological and cultural techniques. Partial purification of amylase was carried out by ammonium sulphate precipitation. The enzyme activity was determined and optimum conditions were obtained. The molecular weights of the crude and partially purified Amylase were determined by SDS PAGE method. A total of five isolates were obtained using basic screening technique for amylase activity, one of the isolates (Isolate code F2) exhibited maximum amylase activity. The fungi isolate code F2 was identified as Aspergillus niger. Optimum conditions for Amylase AMY F2 were ascertained at pH 6.0; temperature 30°C; substrate concentration of 0.3mg/ml, and time of heating of less than 10min. The molecular weights  f the crude and partially purified Amylase AMY F2 were found to be 55kDa and 35kDa respectively by SDS PAGE method. Microorganisms had been an encouraging means of economical production of enzymes in large scale for the food and drug industry.

Keywords: Amylase, Partial Purification, Enzyme, Tomato Fruits

 

Rendement et purification partielle de l’amylase de Aspergillus Niger isolé à partir de tomate déterioré (Lycopersicon Esculentummill.) fruits

Les amylases (EC 3.2.1.1) sont des enzymes dégradant les parois cellulaires associées à la pathogénicité des microorganismes dans la détérioration des fruits à la tomate. L’utilisation de l’amylase dans de nombreuses industries a rendu très important d’optimiser le processus de production pour obtenir des rendements maximaux. Le dépistage et la purification partielle de l’amylase d’Aspergillus niger isolés à partir des fruits à la tomate (Lycopersicon esculentum Mill.) Ont été étudiés. Les champignons producteurs d’amylase ont été isolés à partir de tomates fraîches conservées à température ambiante (28 ± 1 ° C). Les isolats ont été caractérisés en fonction de leurs techniques morphologiques et culturelles. La purification partielle de l’amylase a été réalisée par précipitation au sulfate d’ammonium. L’activité enzymatique a été déterminée et des conditions optimales ont été obtenues. Les poids moléculaires de l’Amylase brut et partiellement purifiée ont été déterminés par un procédé SDS PAGE. Au total, cinq isolats ont été obtenus en utilisant une technique de dépistage basique pour l’activité amylase, l’un des isolats (code isolé F2) présentait une activité amylase maximale. Le code isolant F2 des Fusions a été identifié comme Aspergillus niger. Les conditions optimales pour Amylase AMY F2 ont été déterminées à pH 6,0; température 30 ° C; concentration de substrat de 0,3 mg / ml et temps de chauffage de moins de 10 min. On a trouvé que les poids moléculaires de l’amylase brute et partiellement purifiée étaient respectivement de 55 kDa et 35 kDa par le procédé SDS PAGE. Les microorganismes ont été un moyen encourageant de production économique d’enzymes à grande échelle pour l’industrie alimentaire et pharmaceutique.

Mots-clés: Amylase, Purification partielle, Enzyme, Fruits tomates

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Screening and partial purification of amylase from Aspergillus Niger isolated from deteriorated tomato (Lycopersicon Esculentum mill.) fruits

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Candida auris infection: How prepared is Nigeria for this emerging fungal agent?

S.A Fayemiwo, O.B. Makanjuola

 

Abstract

Reports from Asia and other parts of the world have demonstrated that the incidence of Candida auris infection is on the rise. Candida auris is a fungal pathogen causing a wide variety of infections affecting people of all age groups. Candida auris was first described in 2009 and has since emerged as an important cause of invasive fungal infection, most importantly healthcareassociated candidaemia. Large outbreaks have been reported worldwide, with therapeutic failure and associated high mortality rates recorded.
The emergence and spread of C. auris raises public health concerns because of some characteristics of this pathogen. First it is resistant to many antifungal agents making this infection very difficult to treat. It is also associated with horizontal transmission in health care settings causing outbreaks among hospitalized individuals with high mortality rates. Furthermore, identification of C auris is a challenge. Routine identification methods usually misidentify the organism as other yeasts especially Candida haemulonii.
This review discusses the current knowledge on the epidemiology, treatment and control of this infection. The urgent need for the stakeholders in Nigerian tertiary hospitals to set machinery in motion for prompt diagnosis, management and prevention of transmission of this infection are also discussed.

Infection a Candida auris: Comment le Nigeria est-il prepare pour cet agent fongique emergent?

Des rapports en provenance d’Asie et d’autres parties du monde ont démontré que l’incidence de l’infection à Candida auris est en augmentation. Candida auris est un pathogène fongique causant une grande variété d’infections affectant les personnes de tous les groupes d’âge. Candida auris a été décrit pour la première fois en 2009 et est depuis apparu comme une cause importante d’infection fongique invasive, surtout la candidémie associée aux soins de santé. De grandes épidémies ont été signalées dans le monde entier, avec des échecs thérapeutiques et des taux de mortalité élevés associés enregistrés.
L’émergence et la propagation de C. auris soulèvent des préoccupations en matière de santé publique en raison de certaines caractéristiques de ce pathogène. D’abord, il est résistant à de nombreux agents antifongiques rendant cette infection très difficile à traiter. Il est également associé à la transmission horizontale dans les milieux de soins de santé, ce qui provoque des éclosions parmi les personnes hospitalisées avec des taux de mortalité élevés. De plus, l’identification de C auris est un défi. Les méthodes d’identification de routine confondent généralement l’organisme avec d’autres levures, en particulier Candida haemulonii.
Cette revue discute les connaissances actuelles sur l’épidémiologie, le traitement et le contrôle de cette infection. Le besoin urgent pour les parties prenantes des hôpitaux tertiaires du Nigeria de mettre en place un système de diagnostic rapide, de prise en charge et de prévention de la transmission de cette infection est également discuté

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Candida auris infection How prepared is Nigeria for this emerging fungal agent

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Result of 2004 extended trypanosomosis survey of ruminants at Kachia Grazing Reserve, North Central Nigeria

J.N Abenga, F.A.G Lawani, S.O Omotainse, J.O Kalejaiye, A.B. Ahmed, S.S Shaida, U.B. Shamaki, E. Yanan, U.S Usman, E. Oko, H. Ayakphat, A. Kalgo

 

Abstract

Tsetse fly and trypanosome prevalence in ruminants were estimated in April and August, peak months of the dry and rainy seasons in the Kachia Grazing Reserve (KGR) of Kaduna State, North Central Nigeria. This study was subsequent to reports of seasonal outmigration of semi nomadic Fulani from the grazing reserve due to death of cattle from trypanosomosis. Result of blood samples showed an overall parasitological infection rate of 17.4%. Infection rates in cattle, sheep and goats were, 18.6%, 9.5% and 5.1% respectively. Over all higher infection rate in the rainy season was attributed to abundance of tsetse and other hematophagus flies. Infection rate in younger animals (21.9%) was higher compared to those of older animals (16.5%). Trypanosoma vivax was the dominant infecting trypanosome specie followed by T. congolense andT. brucei.
It was concluded that tsetse fly and trypanosomosis constituted dual plagues limiting economic livestock production and settling of the pastoralists in the grazing reserve. This warrants application of sustainable integrated control measures to enhance utilization of abundant fodder at the reserve.

Key words: Kachia grazing reserve, trypanosomosis, ruminants, infection rates, Nigeria.

 

Resultat de l’enquete de trypanosomose extension de 2004 des ruminants a la reserve de piscine Kachia, Nigeria Centrale du Nord

La prévalence de la mouche tsé-tsé et du trypanosome chez les ruminants a été estimée en avril et août, les mois de pointe des saisons secanes et pluvieuses dans la réserve de pâturage de Kachia (KGR) de l’État de Kaduna, dans le nord du centre du Nigeria. Cette étude a été postérieure à des rapports d’émigration saisonnière de Fulani semi-nomades provenant de la réserve de pâturage en raison de la mort de bovins de la trypanosomose. Le résultat des échantillons de sang a montré un taux global d’infection parasitaire de 17,4%. Les taux d’infection chez les bovins, les ovins et les chèvres étaient respectivement de 18,6%, 9,5% et 5,1%. Le taux d’infection plus élevé pendant la saison des pluies a été attribué à l’abondance de mouches tsé-tsé et d’autres mouches hématophobes. Le taux d’infection chez les animaux plus jeunes (21,9%) était plus élevé par rapport à ceux des animaux plus âgés (16,5%). Trypanosoma vivax était le trypanosome infectant dominant suivi de T. congolense et T. brucei.
On a conclu que la mouche tsé-tsé et la trypanosomose constituaient des fléaux doubles limitant la production d’élevage économique et la colonisation des pasteurs dans la réserve de pâturage. Cela justifie l’application de mesures de contrôle intégrées durables pour améliorer l’utilisation de fourrages abondants dans la réserve.

Mots clés: réserve de pâturage de Kachia, trypanosomose, ruminants, taux d’infection, Nigeria

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Result of 2004 extended trypanosomosis survey of ruminants at Kachia Grazing Reserve, North Central Nigeria

 

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First molecular investigation of capsular serotyping and hypervirulent (hvlp) of K. Pneumoniae in university hospital center of yopougon cote d’ivoire

A. M’lan-Britoh, S. Meité, C. Boni, F. Zaba, K. S. Koffi, N. Guessennd, N. S. Kakou, H. Faye- Kette, M. Dosso

 

Abstract

Klebsiella pneumoniae is a well known human pathogen. Although infectious in most nosocomial infections with a high level of resistance, capsular types and circulating hypervirulent strains in our context are not documented. The aims of this study are to identify capsular serotypes and hypervirulent strains circulating at the Yopougon University Hospital in Abidjan. 51 strains of Klebsiella were collected at Chu de Yopougon. The capsular serotypes were determined using PCR and the serotypes K1, K2 and K5 were searched. The hypervirulent strains were also investigated by PCR and by string test. The predominant serotypes were non-K1 / K2 (46/51, 90%). The serotypes found K5 and K2 in (4/51, 7.8%) and (1/51; 1.9%) respectively. The rmpA gene linked to hyperviscosity or hyperviscosity was not found although 25.5% (12/51) were positive for the stretch test. The capsular distribution of strains of Klebsiella pneumoniae seems different from Asian authors. The determination of non-K1non types K2 remains to be elucidated.

Keyvords: Klebsiella pneumoniae, capsular serotype, hypervirulence

Premiere etude d’investigation moleculaire de serotypage capsulaire et de gene d’hypervirence de klebsiella pneumniae au laboratoire du chu de yopougon en cote d’ivoire

Klebsiella pneumoniae est un pathogène nosocomial humain bien connu. Bien qu’incriminé dans la plus part des infections nosocomiales avec un niveau élevé de résistance, les types capsulaires et les souches hypervirulentes circulantes dans notre contexte ne sont pas documentés. L’objectif de cette étude est d’identifier les sérotypes capsulaires et les souches hypervirulentes circulant au CHU de Yopougon Abidjan., 51 souches de Klebsiella ont été collectés au Chu de Yopougon. Les sérotypes capsulaires ont été déterminée à l’aide de la PCR et les sérotypes K1, K2 et K5 ont été recherchés. Les souches hypervirulentes ont été recherchées également par PCR et par le test d’étirement ou string test. Les sérotypes prédominants étaient les non K1/K2 (46/51; 90%). Les sérotypes retrouvés K5 et K2 dans respectivement (4/51; 7,8%) et (1/51 ; 1,9%). Le gène rmpA lié à l’hyperviscosité n’a pas été retrouvé bien que 25,5% (12/51) étaient positives au test d’étirement. La distribution capsulaire des souches de Klebsiella pneumoniae semble différente des auteurs asiatiques. D’ou l’intérêt de travaux plus approfondies afin de déterminer les types capsulaire des souches non K1 non K2.

Mots clefs : Klebsiella pneumoniae, serotype capsulaire , Hypervirulence

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First molecular investigation of capsular serotyping and hypervirulent (hvlp) of K. Pneumoniae in university hospital center of yopougon cote d’ivoire